机关事业单位按比例安排残疾人就业时，已安排的劳务派遣人员一般不算作本单位直接安排的残疾人就业人数，但具体需视地方政策及派遣协议内容而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、政策规定角度
根据《残疾人就业条例》及相关地方实施细则，机关、团体、企业、事业单位和民办非企业单位等用人单位，应当按照不低于本单位在职职工总数1.5%（具体比例可能因地区而异）的比例安排残疾人就业。这里的“安排残疾人就业”通常指的是用人单位直接与残疾人签订劳动合同，建立劳动关系，并为其提供工作岗位和支付工资报酬。
对于劳务派遣人员，由于其劳动关系是与劳务派遣单位建立的，而非与实际用工单位（即机关事业单位）直接建立，因此，在大多数情况下，劳务派遣的残疾人并不被计入实际用工单位按比例安排残疾人就业的人数中。
二、地方政策差异
然而，需要注意的是，不同地区可能会根据本地实际情况制定更为具体的实施细则或政策。有些地区可能会出台特殊政策，允许在一定条件下将劳务派遣的残疾人计入实际用工单位的安排残疾人就业人数。例如，如果劳务派遣协议中明确约定了残疾人用工的相关事宜，且实际用工单位对残疾人的工作安排、工资支付等承担了主要责任，那么该地区可能会认可这种安排方式。
三、实际操作建议
查阅地方政策：首先，建议您查阅所在地区关于按比例安排残疾人就业的具体政策文件，了解当地对劳务派遣人员是否计入安排残疾人就业人数的具体规定。
与劳务派遣单位协商：如果地方政策允许或存在模糊地带，您可以与劳务派遣单位进行协商，明确双方在残疾人用工方面的责任和义务，并尝试在派遣协议中作出相应约定。
咨询相关部门：对于政策理解或实际操作中的疑问，您可以向当地残疾人联合会、人力资源和社会保障部门等相关机构进行咨询，以获取更准确、权威的解答。
四、法律后果提示
如果机关事业单位未按照规定比例安排残疾人就业，且未通过缴纳残疾人就业保障金等方式履行法定义务，可能会面临行政处罚等法律后果。因此，建议您在安排残疾人就业时务必遵守相关法律法规和政策规定。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供更为详细、专业的法律建议。