一般情况下，用人单位实行“无底薪扣费考勤”的制度是不合法的，但存在特定例外情形。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的不合法性
最低工资保障：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。这意味着，无论采用何种工资计算方式（包括无底薪制度），劳动者的最终收入都不应低于这一标准。若因扣费考勤导致劳动者工资低于最低工资标准，则该制度不合法。
工资扣除限制：
- 《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。这表明，即使存在考勤问题，扣除也需有限度，不能随意扣费。
二、特定例外情形
劳动合同或规章制度中的明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了无底薪及考勤扣除方式，并且劳动者在签订合同时已知悉并同意，那么这种制度在法律上可能被视为合法。但需注意，这种合法性是有条件的，即扣除方式需符合相关法律法规，如不得违反最低工资保障和工资扣除限制的规定。
劳动者过错导致的经济损失：
- 在一些特殊情况下，如劳动者因自身过错给用人单位造成经济损失，且用人单位有合法的规章制度规定可以扣除工资的，在扣除的范围内是合法的。但同样，扣除后的工资仍不得低于当地最低工资标准。
三、劳动者的应对策略
了解与沟通：
- 劳动者应仔细查阅劳动合同和公司规章制度，了解自己的薪资结构和考勤规定。如有疑问或认为不合理，应及时与用人单位沟通协商，寻求解决方案。
收集证据：
- 在维权过程中，劳动者应收集并保存好所有相关证据，包括劳动合同、工资条、考勤记录、沟通记录等，以便在需要时证明自己的主张。
正式投诉与仲裁：
- 若协商无果，劳动者可以向工会求助，或直接向当地的劳动监察部门投诉。必要时，还可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼。
保持冷静与理性：
- 面对劳动纠纷，劳动者应保持冷静与理性，避免采取过激行为。通过合法途径维护自己的权益，既是对自身权益的尊重，也是对法律秩序的维护。
总结来看，“无底薪扣费考勤”是否合法需根据具体情况判断。劳动者在遇到此类问题时，应充分了解自己的权益和法律规定，通过合法途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。