考勤扣绩效是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司规章制度合法且已公示，且考勤扣绩效的规定合理：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
   • 如果公司的考勤扣绩效制度经过了上述合法程序制定，并且已经向劳动者进行了公示或告知，同时该制度中的考勤扣绩效规定合理，没有违反法律法规的强制性规定，也没有显失公平，那么公司根据该制度对劳动者进行考勤扣绩效是合法的。例如，公司规定迟到或早退超过一定时间将扣除相应比例的绩效工资，且该比例在合理范围内，这样的规定通常是合法的。

2. 若公司规章制度不合法或未公示，或考勤扣绩效的规定不合理：

   • 如果公司的考勤扣绩效制度没有经过合法程序制定，或者没有向劳动者进行公示或告知，那么该制度对劳动者不具有约束力，公司不能根据该制度对劳动者进行考勤扣绩效。
   • 另外，即使公司的考勤扣绩效制度经过了合法程序制定并公示，但如果其中的规定不合理，如扣除绩效工资的比例过高，或者对劳动者的处罚过于严厉，显失公平，那么这样的规定也可能被认定为无效，公司不能根据该无效规定对劳动者进行考勤扣绩效。例如，公司规定只要迟到就扣除全部绩效工资，这样的规定显然过于严厉，可能被认定为无效。

法律建议：

• 对于劳动者而言，如果公司存在考勤扣绩效的情况，首先应当查看公司的相关规章制度，了解该制度是否经过了合法程序制定并公示，以及其中的考勤扣绩效规定是否合理。如果认为公司的规定不合法或不合理，可以与公司进行协商，要求公司改正。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于公司而言，在制定考勤扣绩效制度时，应当确保该制度经过了合法程序制定并公示，同时其中的规定应当合理合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得显失公平。否则，该制度可能被认定为无效，公司不能根据该制度对劳动者进行考勤扣绩效。

可能后果：

• 如果公司违法对劳动者进行考勤扣绩效，劳动者有权要求公司补发被扣除的绩效工资，并可能要求公司支付经济补偿金或赔偿金。
• 如果劳动者因此与公司发生劳动争议，可能需要通过劳动仲裁或诉讼等法律途径解决争议，这将耗费双方的时间和精力。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。