行政协议约定的仲裁条款原则上无效，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：

一、行政协议仲裁条款原则上无效

根据《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》第二十六条，行政协议约定仲裁条款的，人民法院应当确认该条款无效，但法律、行政法规或者我国缔结、参加的国际条约另有规定的除外。这一规定基于行政协议的特殊性质。行政协议不仅具有合同性，更具有行政性，其订立、履行、变更、终止等往往涉及行政权力的行使和公共利益的考量。而仲裁主要适用于平等主体之间的民商事纠纷，行政机关在行政协议中处于主导地位，与相对人并非完全平等的民事主体关系。若允许行政协议约定仲裁，可能导致行政机关利用优势地位迫使相对人放弃法定救济途径，损害相对人的合法权益，也不利于行政争议的公正、统一解决。

二、例外情况：法律、行政法规或国际条约另有规定

尽管行政协议仲裁条款原则上无效，但存在例外情况。即当法律、行政法规或者我国缔结、参加的国际条约另有规定时，行政协议中的仲裁条款可能有效。这种情况较为少见，需要严格依据具体法律规定来判断。例如，在某些特定的国际经济合作或投资领域，可能存在相关的国际条约或国内法律明确允许行政协议约定仲裁。

三、法律建议

1. 在签订行政协议时，应谨慎考虑仲裁条款：由于行政协议仲裁条款原则上无效，双方在签订行政协议时，应尽量避免约定仲裁作为争议解决方式。相反，可以考虑通过行政复议、行政诉讼等法定途径来解决争议。
2. 关注法律、行政法规和国际条约的更新：虽然目前行政协议仲裁条款原则上无效，但法律、行政法规和国际条约可能会随着时间和形势的变化而更新。因此，双方在签订和履行行政协议过程中，应密切关注相关法律法规的更新，以便及时调整争议解决策略。
3. 寻求专业法律帮助：在签订和履行行政协议过程中，如果涉及复杂的法律问题或争议解决方式的选择，建议寻求专业律师的帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，帮助双方规避法律风险并维护自身合法权益。

如有任何关于行政协议或其他法律问题的疑问，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。