如果医院已经开了病假单，但单位不同意，您完全有权向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，以维护自身合法权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律依据与权利保障
病假权利：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规，劳动者在规定的医疗期内享有病假权利。这意味着，只要您符合医疗期的条件，并提供了正规医疗机构出具的诊断证明和病假单，您就有权休病假。
用人单位义务：
- 用人单位应依法给予劳动者病假，并支付相应的病假工资。如果用人单位无正当理由拒绝批准您的病假申请，或者因您休病假而对您作出不当处理（如解除劳动合同、克扣工资等），则违反了法律规定和劳动合同约定，侵害了您的合法权益。
二、可以申请仲裁的情形
用人单位不批准合理病假：
- 如果您已经按照单位规章制度提供了正规医疗机构出具的诊断证明和病假单，请求休病假，但用人单位无正当理由拒绝批准，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
用人单位因劳动者休病假作出不当处理：
- 如果用人单位以您休病假为由解除劳动合同，或者克扣、拖欠您的病假工资，您同样有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
三、申请仲裁的流程与注意事项
准备材料：
- 仲裁申请书：明确您的请求和理由。
- 证明劳动关系的材料：如劳动合同、工资发放记录、工作证等。
- 医院的诊断证明和病假单：作为您休病假的依据。
- 与用人单位沟通病假事宜的相关记录：如邮件、聊天记录等，以证明您已经按照单位要求提供了相关材料。
提交申请：
- 向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。通常，这可以是劳动合同履行地或用人单位所在地的仲裁委员会。
仲裁审理：
- 仲裁委员会受理后，将安排开庭审理。在庭审中，您需要陈述事实、提供证据，并进行辩论。
裁决结果：
- 仲裁委员会将根据双方提供的证据和庭审情况作出裁决。如果您对仲裁结果不服，可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。
四、建议与提醒
- 保留证据：在申请仲裁前，请确保您已经保留了所有与病假相关的证据，包括医院的诊断证明、病假单、与用人单位的沟通记录等。
- 及时行动：如果您认为用人单位的行为已经侵害了您的合法权益，请及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以免错过时效。
- 寻求帮助：如果您在申请仲裁过程中遇到任何困难或疑问，可以随时向我咨询，我将竭诚为您提供法律帮助。