结论：老板既扣工资又扣全勤的做法是否合理，需根据具体情况和相关法律法规来判断。一般情况下，若员工无故缺勤，老板有权扣除相应工资，但全勤奖的扣除需依据公司规章制度且该制度需合法合理。
一、关于工资扣除
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工应当按照劳动合同约定和国家规定，向用人单位提供正常劳动。若员工无故缺勤，未提供正常劳动，用人单位有权按照其规章制度扣除相应工资。
实际操作：
- 在实际操作中，老板扣除工资的行为通常基于公司内部的考勤制度和工资管理制度。若这些制度明确规定了无故缺勤的工资扣除标准，并且该制度已经过民主程序制定并公示给员工，那么老板扣除工资的行为就是合法的。
二、关于全勤奖扣除
全勤奖性质：
- 全勤奖是用人单位为了鼓励员工全勤出勤而设立的一种奖励制度。其本质是一种额外的福利，而非员工应得的固定工资。
扣除条件：
- 全勤奖的扣除通常依据公司内部的规章制度。若规章制度中明确规定了全勤奖的扣除条件，如无故缺勤、迟到早退等，并且该制度已经过民主程序制定并公示给员工，那么老板在员工违反这些条件时扣除全勤奖就是合法的。
- 但需注意，全勤奖的扣除不能违反法律法规的强制性规定，也不能显失公平。例如，不能因为员工一次无故缺勤就扣除全部全勤奖，而应考虑缺勤的次数、时长等因素。
三、综合分析
若公司规章制度合法合理：
- 如果公司的考勤制度、工资管理制度以及全勤奖制度都经过了民主程序制定并公示给员工，且这些制度中明确规定了无故缺勤的工资和全勤奖扣除标准，那么老板既扣工资又扣全勤的做法就是合法的。
若公司规章制度存在问题：
- 如果公司的相关制度未经民主程序制定或未公示给员工，或者制度中的扣除标准显失公平、违反法律法规的强制性规定，那么老板既扣工资又扣全勤的做法就可能不合法。此时，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
四、建议
对于员工：
- 在入职时，应仔细阅读并了解公司的各项规章制度，特别是与工资、考勤和奖励相关的制度。
- 若对公司的扣除行为有异议，可以先与老板或人力资源部门沟通协商，若无法解决，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于老板：
- 在制定和执行相关制度时，应确保制度的合法性和合理性，避免因为制度问题而引发劳动纠纷。
- 在与员工沟通时，应保持透明和公正，解释清楚扣除工资和全勤奖的原因和依据。
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