年底发放的工资被扣了一部分，辞职后这部分被扣的工资是有可能要回的，但具体能否要回以及要回的金额，需根据实际情况和法律规定来判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、工资扣除的合法性
合法扣除：
- 如果扣除的工资部分是基于合法的理由，如员工因个人原因给公司造成了经济损失，且公司按照劳动合同或公司规章制度的规定进行了合理的扣除，那么这部分扣除可能是合法的。在这种情况下，员工辞职后要求返还这部分被扣的工资，可能不会得到法律的支持。
非法扣除：
- 如果扣除的工资部分没有合法的依据，或者扣除的金额超出了法律规定的范围，那么这部分扣除就是非法的。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。在这种情况下，员工辞职后有权要求公司返还这部分被非法扣除的工资。
二、如何要回被扣的工资
与公司协商：
- 员工可以先尝试与公司进行协商，了解工资扣除的具体原因，并要求公司返还非法扣除的部分。如果公司同意返还，那么问题就可以得到解决。
申请劳动仲裁：
- 如果与公司协商无果，员工可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁时，员工需要提供相关的证据，如工资条、劳动合同、公司规章制度等，以证明公司非法扣除了工资。劳动争议仲裁委员会将根据事实和法律规定进行裁决，如果裁决支持员工的请求，那么公司就需要返还非法扣除的工资。
提起诉讼：
- 如果对劳动仲裁的裁决不服，员工还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，员工需要继续提供证据来支持自己的主张。如果法院最终判决支持员工的请求，那么公司就需要按照判决结果返还非法扣除的工资。
三、注意事项
保留证据：
- 员工在要求返还被扣工资的过程中，一定要保留好相关的证据，如工资条、劳动合同、公司规章制度、与公司的协商记录等。这些证据将有助于员工证明自己的主张，并增加要回被扣工资的成功率。
注意时效：
- 员工在要求返还被扣工资时，还需要注意时效问题。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，员工需要在规定的时效期间内提出仲裁申请或提起诉讼。
建议：如果你遇到了年底发放的工资被扣了一部分的情况，并且认为这部分扣除是非法的，那么你可以先尝试与公司进行协商。如果协商无果，你可以及时向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁或向人民法院提起诉讼来维护自己的合法权益。如果你在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。