结论是：这种情况是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论。
如果两个老板之间存在合法的委托或代理关系：
- 在这种情况下，大老板委托小老板代为发放工资，且这种委托关系是合法且明确的，那么小老板作为受托人代为发放工资并不违法。关键在于这种委托关系需要有明确的证据支持，比如书面委托协议等，以确保工资发放的合法性和透明度。
如果两个老板之间不存在合法的委托或代理关系，或者存在恶意串通以逃避法律责任的情况：
- 如果大老板和小老板之间没有合法的委托或代理关系，而是通过这种层级结构来故意混淆劳动关系、逃避法律责任（比如逃避社保缴纳、工伤赔偿等），那么这种行为就可能构成违法。特别是当这种层级结构导致员工权益受损，且无法通过正常法律途径获得救济时，法律会对此类行为进行负面评价。
- 另外，如果这种层级结构被用于掩盖非法目的，比如偷逃税款、洗钱等，那么相关行为不仅违反劳动法，还可能涉及更严重的刑事犯罪。
法律建议：
- 对于员工而言，如果遇到这种情况，首先应当要求明确自己的劳动合同关系是与哪个主体建立的，以及工资发放的具体责任主体是谁。如果发现自己的权益受到侵害，比如工资被拖欠、社保未缴纳等，应当及时收集证据并寻求法律帮助。
- 对于老板而言，如果确实需要通过层级结构来管理公司，应当确保这种结构是合法且透明的，避免因为结构复杂而导致法律责任不清。同时，应当严格遵守劳动法律法规，保障员工的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果这种层级结构被用于非法目的或者导致员工权益受损，相关责任主体可能会面临劳动行政部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。
- 在严重情况下，如果涉及刑事犯罪，相关责任主体还可能面临刑事追究。
因此，建议无论是员工还是老板，在遇到涉及工资发放等劳动关系问题时，都应当谨慎处理并寻求专业法律意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。