用人单位违反劳动合同并恢复劳动合同后，赔偿的计算基数通常是全额工资，而非仅基本工资。以下是对此问题的详细分析：
一、赔偿计算基数的法律依据
在劳动合同被违法解除或终止后，如果劳动者要求恢复劳动关系并获得支持，用人单位需要支付劳动者在违法解除或终止期间的工资损失。这一工资损失的计算，通常是以劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资为基数，这包括了基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入，即全额工资。
二、全额工资作为赔偿基数的合理性
全面补偿原则：全额工资作为赔偿基数，能够更全面地补偿劳动者因用人单位违法行为所遭受的损失。基本工资只是劳动者收入的一部分，如果仅以基本工资为基数进行赔偿，将无法充分补偿劳动者的实际损失。
法律公平性：法律旨在保护劳动者的合法权益，确保劳动者在遭受用人单位违法行为时能够得到充分的救济。以全额工资为赔偿基数，体现了法律的公平性和正义性。
三、特殊情况下的赔偿计算
虽然全额工资是赔偿计算的主要基数，但在某些特殊情况下，赔偿的计算可能会有所不同。例如：
劳动者工资过高：如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么支付经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。不过，这种情况主要适用于经济补偿的计算，而在恢复劳动关系后的工资损失赔偿中，通常仍以全额工资为基数。
双方约定或行业惯例：在某些特定行业或岗位中，可能存在双方约定或行业惯例，对赔偿的计算基数有特别规定。然而，这些约定或惯例必须符合法律法规的规定，不得损害劳动者的合法权益。
四、法律建议
保留证据：劳动者在遭遇用人单位违法行为时，应保留好相关证据，如劳动合同、工资单、解除或终止劳动合同的通知等，以便在维权时提供有力支持。
及时维权：劳动者在发现用人单位存在违法行为时，应及时向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
咨询专业律师：在处理劳动争议时，劳动者可以咨询专业律师，以获取更全面的法律建议和帮助。
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