赔偿金通常是按照应发工资来计算，而非基本工资或实发工资。以下是对这一结论的详细阐述：

一、应发工资、实发工资与基本工资的定义及区别

1. 应发工资：指劳动者在提供了正常劳动情况下，用人单位应当支付给劳动者的全部工资报酬，包括岗位工资、薪级工资、绩效工资、奖励金、加班工资等各项收入的总和。
2. 实发工资：则是劳动者在扣除相关税费（如个人所得税）、社会保险费（如五险一金）等之后实际到手的薪资。
3. 基本工资：通常是劳动者工资构成中的固定部分，是劳动者在正常工作时间内提供正常劳动后应得的报酬，但一般不包括奖金、津贴、补贴等变动部分。

二、赔偿金计算的一般原则

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条及其实施条例第二十七条的规定，经济补偿（赔偿金常以经济补偿标准为基础计算）是按劳动者在本单位工作的年限来计算的，每满一年支付一个月工资的标准。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，且该平均工资的计算应基于劳动者应得工资，即包括计时工资或计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入在内的总额。这意味着赔偿金的计算是基于应发工资，而非基本工资或实发工资。

三、特殊情况的处理

1. 高薪限制：如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。在这种情况下，赔偿金的计算仍然是以应发工资为基础，但受到了上限的限制。
2. 不满一年的情况：对于工作不满十二个月的劳动者，其月工资应按照实际工作的月数来计算平均工资，同样是以应发工资为基础进行计算。
3. 其他类型赔偿金：除了经济补偿金外，员工还可能因其他原因获得赔偿金，如违法解除劳动合同的赔偿金、未签订劳动合同的双倍工资差额等。这些赔偿金的计算方式和依据也各不相同，但通常也是以应发工资为基础进行计算。例如，违法解除劳动合同的赔偿金是按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付，而经济补偿标准本身又是以应发工资为基础计算的。

四、实际操作中的注意事项

1. 工资构成的复杂性：在实际操作中，由于工资构成可能包括基本工资、奖金、津贴、补贴等多个部分，因此在计算赔偿金时，需要明确哪些部分应计入工资总额。一般来说，应发工资包括了所有应得的货币性收入，是计算赔偿金的基础。
2. 地区差异：不同地区的法律法规和司法实践可能存在差异，因此在计算赔偿金时需要参考当地的具体规定。例如，某些地区可能对于赔偿金的计算有特定的规定或解释，需要仔细审查相关法律法规和事实情况。

总结与建议：

赔偿金通常是按照应发工资来计算，这能够更全面地反映劳动者的实际收入情况，并确保赔偿的公平性和合理性。在处理具体案件时，应仔细审查相关法律法规和事实情况，以准确确定赔偿金的计算标准。如果您在赔偿金计算方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。