违法辞退员工的赔偿是按照应得工资来计算的，而非基本工资或到手工资。这一结论基于我国相关法律法规的明确规定，旨在全面、公平地保障劳动者的合法权益。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与计算标准
根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的“月工资”明确指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，且为应得工资。应得工资包括计时工资、计件工资以及奖金、津贴、补贴等货币性收入，是扣除各类扣款项目之前的工资总额。
二、应得工资与到手工资、基本工资的区别
- 应得工资：是用人单位在一定时期内直接支付给劳动者的全部劳动报酬，包含个人所得税、社会保险费个人缴纳部分、住房公积金个人缴纳部分等扣款前的总额。它全面反映了劳动者的劳动报酬水平。
- 到手工资：是劳动者实际收到的工资数额，即应得工资扣除各种税费和代扣款项后的净额。
- 基本工资：只是劳动者收入的一部分，通常指底薪或固定工资，不包括奖金、津贴等变动部分。
三、赔偿计算的具体操作
- 计算范围：在计算经济补偿时，应将劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的所有货币性收入纳入计算范围，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。
- 特殊情况剔除：虽然原则上应包含所有货币性收入，但在实际操作中需剔除一些特殊情况，如加班工资（若某月加班过多导致平均工资偏高，可适当剔除以反映真实收入水平），但这一剔除并非绝对，需根据具体情况判断。不过，在大多数情况下，加班工资也是劳动者收入的一部分，应纳入计算范围，除非能证明某月加班工资异常高且不代表常态。
- 工作年限与赔偿金额：根据劳动者在本单位的工作年限，按照每满一年支付一个月平均工资的标准来计算经济补偿总额。对于工作不满一年的部分，按比例折算。例如，若劳动者工作了一年半，则应支付一个半月工资的经济补偿。
- 违法辞退的赔偿：如果用人单位违法辞退员工，即没有合法的理由辞退员工，那么用人单位应当按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 最低保障：如果劳动者的应得工资低于当地最低工资标准，那么在计算经济补偿时，应按照当地最低工资标准来确定月工资。
四、举例说明
假设员工小李在某公司工作了三年，每月应得工资为8000元（包括基本工资5000元、奖金2000元、津贴1000元），扣除税费和社保公积金后到手6500元。若公司违法辞退小李，则应支付的经济补偿为：
- 计算月工资：以劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资为准，即8000元。
- 计算工作年限：小李工作了三年，应支付三个月工资的经济补偿。
- 计算赔偿金额：三个月工资的经济补偿为8000元×3=24000元。因公司违法辞退，所以需支付双倍赔偿，即24000元×2=48000元。
五、特殊情况处理
- 高薪员工的补偿限制：如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么向其支付经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额来支付，且支付年限最高不超过十二年。
- 无需支付经济补偿的情形：如果劳动者存在《劳动合同法》第三十九条规定的情形，如严重违反用人单位的规章制度等，用人单位在解除劳动合同时是不需要支付任何经济补偿的。
综上所述，违法辞退员工的赔偿是按照应得工资来计算的，这一规定体现了法律法规对劳动者权益的全面保障。如果你在劳动纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。