在劳动能力鉴定期间，如果仍处于停工留薪期内，公司应当继续发放工资。以下是对此问题的详细分析：

一、停工留薪期内的工资支付

根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，在停工留薪期内，即使职工没有实际工作，公司也需要按照其受伤前的工资标准支付工资。

• 停工留薪期的期限：一般不超过12个月。如果伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。
• 工资支付标准：原工资福利待遇不变，即按照职工受伤前12个月的平均工资支付。

二、劳动能力鉴定与停工留薪期的关系

劳动能力鉴定是确定职工工伤等级和享受相应工伤保险待遇的重要依据。然而，在劳动能力鉴定结论尚未作出之前，如果职工仍处于停工留薪期内，公司仍然需要按照上述规定支付工资。

• 鉴定期间的工资支付：只要职工在停工留薪期内，无论是否进行劳动能力鉴定，公司都需要支付工资。
• 鉴定后的待遇变化：一旦工伤职工评定伤残等级后，将停发原待遇，按照相关规定享受伤残待遇。

三、特殊情况下的工资支付

虽然一般情况下公司在停工留薪期内需要支付工资，但也存在一些特殊情况：

• 用人单位遇到非人力所能抗拒的自然灾害、战争等原因：如果用人单位因这些原因无法按时支付工资，不属于拖欠工资。
• 用人单位确因生产经营困难、资金周转受到影响：在征得本单位工会同意后，用人单位可以暂时延期支付劳动者工资。但这种情况并不适用于停工留薪期内的工资支付，除非能证明停工留薪期的延长是由于这些特殊原因导致的，且已征得工会同意。

四、法律建议

• 保留证据：职工应保留好与工伤相关的所有证据，包括医疗记录、工伤认定决定书等，以便在需要时证明自己的权益。
• 及时沟通：如果公司未按照规定支付工资，职工应及时与公司沟通，要求其履行支付义务。
• 寻求法律援助：如果公司拒绝支付工资或存在其他违法行为，职工可以向当地劳动行政部门投诉或寻求法律援助。

如有任何关于工伤赔偿、劳动纠纷等方面的法律问题，都可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。