员工可以在补签的劳动合同上手写备注是补签劳动合同，但需注意备注的方式和内容需合法合规，且不影响劳动合同的整体效力。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律层面

1. 劳动合同的补签：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。若未及时订立，用人单位应在用工之日起一个月内与劳动者补签书面劳动合同。补签的劳动合同，只要内容合法、双方自愿，即具有法律效力。

2. 手写备注的合法性：员工在补签的劳动合同上手写备注，本质上是对劳动合同内容的补充或说明。只要备注内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，且双方对此无异议，那么该备注就是合法的。

二、实际操作层面

1. 备注内容：员工在手写备注时，应明确注明是“补签劳动合同”，并可以简要说明补签的原因或背景，如“因入职时未及时签订，现补签此合同”。这样的备注有助于明确双方的权利义务，避免后续纠纷。

2. 双方确认：手写备注后，应确保双方（即用人单位和劳动者）都在备注处签字或盖章确认，以证明双方对此备注内容的认可和接受。这是确保备注具有法律效力的关键步骤。

3. 劳动合同的整体性：虽然手写备注是合法的，但应注意不要破坏劳动合同的整体性和完整性。备注内容应与劳动合同的其他条款相协调，不得产生矛盾或冲突。

三、风险提示

1. 备注内容的合法性：员工在备注时，应避免写入违法或违规的内容，如免除用人单位的法定责任、排除劳动者的合法权利等。这样的备注不仅无效，还可能引发法律纠纷。

2. 用人单位的态度：虽然法律允许员工在补签的劳动合同上手写备注，但用人单位可能对此持不同态度。因此，在备注前，员工最好与用人单位进行沟通，确保双方对此无异议。

3. 后续纠纷的预防：即使手写了备注，也不能完全避免后续纠纷的发生。因此，员工在补签劳动合同时，应仔细阅读合同条款，确保自己的权益得到充分保障。如有需要，可以寻求专业律师的帮助。