针对您提出的“农民土地违规建厂怎么处理”的问题，这是一个涉及土地管理和城乡规划的重要议题，需要依据相关法律法规进行严肃处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、违规建厂的法律性质
未经批准在农民土地上违规建厂，属于擅自改变土地用途的违法行为。这违反了《土地管理法》中关于土地用途管制制度的规定，该制度严格限制农用地转为建设用地。
二、处理程序与措施
调查核实：
- 当自然资源主管部门（如县级以上人民政府自然资源主管部门）发现或接到举报后，会立即展开调查。
- 调查方式包括现场勘查、资料查阅和询问相关人员等，以核实占用土地的具体情况，包括面积、位置、建设情况及是否办理合法审批手续。
责令停止与限期拆除：
- 一旦确认违法，自然资源主管部门将下达《责令停止违法行为通知书》，要求立即停止建设。
- 依据《土地管理法》的相关规定，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
罚款处罚：
- 对非法占用土地的单位和个人，将处以每平方米100元以上1000元以下的罚款。
- 同时，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分。
恢复种植条件与土地复垦：
- 被破坏的耕地需按照相关标准进行复垦，以恢复其种植条件。
- 复垦义务人应编制土地复垦方案并按规定执行。若未履行复垦义务，将面临限期改正、缴纳复垦费及可能的罚款。
刑事责任追究：
- 若非法占用耕地数量较大，造成耕地大量毁坏，可能触犯《刑法》第三百四十二条规定的非法占用农用地罪。
- 根据该条款，违反土地管理法规，非法占用耕地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大且造成严重后果的，将处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
三、合法建议与途径
遵守法律法规：
- 强烈建议遵守相关法律法规，不要占用农民土地违规建厂。
- 如需建设工厂或其他设施，应按照法定程序申请建设用地，并获得相关部门的批准和许可。
主动接受处理：
- 对于已存在的违法情况，应立即停止违法行为，并主动接受相关部门的处理。
- 可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自身权益，但应在合法合规的前提下进行。
寻求合法解决方案：
- 若厂房符合土地利用总体规划和城乡规划等要求，在接受处罚后，可依法补办相关审批手续使其合法化。
- 可以咨询专业律师或土地管理机构，寻求合法、合规的解决方案。
四、总结与提醒
未经批准在农民土地上违规建厂是严重的违法行为，不仅面临行政处罚，还可能触及刑事责任。因此，务必遵守土地管理法规，确保土地使用合法合规。如果发现此类违法行为，可以向当地的自然资源管理部门、城乡规划部门或城市管理综合执法部门反映情况，这些部门对违法建设行为有监管和查处职责。
希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时联系专业律师或相关机构。