针对您提出的“违规占地建厂多年了怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，违规占地建厂，特别是占用耕地建厂，是违反我国土地管理法律法规的行为。对于此类违规行为，处理方式通常包括以下几个方面：
责令退还非法占用的耕地： 由县级以上人民政府自然资源主管部门负责，要求违规者退还非法占用的耕地，恢复土地的原有用途。
限期拆除非法建筑并恢复土地原状： 对于在耕地上新建的厂房和其他设施，相关部门会责令违规者在规定期限内拆除，并恢复土地至可耕种状态。
依法追究刑事责任： 如果违规占地建厂的行为构成犯罪，如非法占用基本农田5亩以上或其他耕地10亩以上，涉嫌非法占用农用地罪，将依法追究刑事责任。
行政处罚与罚款： 除了上述措施外，相关部门还可能对违规者进行行政处罚，并处以罚款，以作为对其违规行为的惩戒。
在处理此类问题时，相关部门会依据《土地管理法》、《土地管理法实施条例》、《农业法》、《环境保护法》、《城乡规划法》等相关法律法规进行。这些法律法规明确了耕地保护的基本原则、耕地占用的限制以及违法用地的处罚等具体规定。
此外，对于违规占地建厂的行为，其认定标准主要取决于是否经过批准以及是否办理了农用地转用审批手续。如果未经批准或未办理相关手续，则属于违建行为。
针对您提到的“违规占地建厂多年了”这一情况，无论违规时间多长，只要存在违规行为，相关部门都有权进行查处，并采取相应的处理措施。因此，建议您尽快与当地自然资源主管部门联系，了解具体情况并配合处理，以避免可能的法律风险和更严重的后果。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告知。