对于农村违章工厂的处理，我国有着明确的法律规定和相应的处罚措施。以下是对这一问题的详细解答：

一、违章工厂的认定

首先，需要明确什么是违章工厂。一般来说，违章工厂指的是在农村地区，未经批准或违反相关法律法规规定，擅自建设或运营的工厂。这些工厂可能存在非法占地、破坏耕地、非法转让土地或非法批准用地等违法行为。

二、处理流程与处罚措施

对于违章工厂，相关部门将依据其违法行为的性质和严重程度，采取相应的处理流程和处罚措施。

1. 调查与取证：

   • 相关部门会对涉嫌违章的工厂进行调查，包括现场勘查、询问当事人、收集证据等。
   • 调查过程中，会制作现场检查笔录、勘察平面图、照片等证据材料。

2. 认定与告知：

   • 根据调查取证的结果，相关部门会认定工厂是否存在违法行为。
   • 如果存在违法行为，会向当事人发出《行政处罚事先（听证）告知书》，告知其陈述申辩权、听证权等。

3. 行政处罚：

   • 对于认定的违法行为，相关部门会依据相关法律法规进行行政处罚。处罚措施包括但不限于：
     • 责令退还：非法占用的土地，需退还给原土地所有者或使用者。
     • 拆除或没收：对于违反土地利用总体规划新建的建筑物和其他设施，责令限期拆除或予以没收。
     • 罚款：根据违法占用土地的类型和面积，处以相应的罚款。例如，占用永久基本农田的，处每平方米1000元罚款；占用其他土地的，处每平方米500元以上800元以下罚款等。
     • 刑事责任：如果违法行为构成犯罪，如非法占用农用地罪、非法转让土地使用权罪等，将依法追究刑事责任。

4. 执行与监督：

   • 当事人需在规定期限内履行行政处罚决定。如果逾期不履行，相关部门有权采取很多强制措施，像是冻结银行账户、查封财产等，甚至可能被追究刑事责任。
   • 相关部门还会对处罚决定的执行情况进行监督，确保处罚措施得到有效落实。

三、建议与措施

为了避免农村违章工厂的出现，建议采取以下措施：

• 加强宣传与教育：提高农村地区居民的法律意识和环保意识，让他们了解违法建设工厂的后果和危害。
• 完善审批制度：建立健全农村工厂建设的审批制度，确保所有工厂都经过合法审批和规划。
• 加强监管与执法：相关部门应加强对农村地区的监管和执法力度，及时发现和查处违章工厂。

总之，对于农村违章工厂的处理，需要依据相关法律法规进行严格的调查和处罚。同时，也需要通过加强宣传与教育、完善审批制度、加强监管与执法等措施，预防违章工厂的出现。