结论：若您在休假期间确实在工作，但公司却认定您为旷工，这很可能涉及公司的管理错误或是对您休假情况的误解。您有权要求公司核实情况并纠正错误，必要时，可以通过法律途径维护自己的合法权益。
一、休假期间工作的法律性质
带薪年休假：根据《职工带薪年休假条例》的规定，职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。在年休假期间，职工应享受与正常工作期间相同的工资收入。若您申请的是带薪年休假，且公司已批准，那么您在休假期间的工作（如果确实存在）并不影响您享受年休假待遇，公司也不能因此认定您为旷工。
其他休假类型：如果您申请的是其他类型的休假（如病假、事假等），且公司已批准，那么在休假期间您本不应承担工作任务。若您在此期间工作，可能是出于个人意愿或公司紧急需求，但这并不改变您休假的事实，公司也不应因此认定您为旷工。
二、公司认定旷工的可能原因及应对
信息沟通不畅：公司可能因内部信息沟通不畅，未能及时了解到您在休假期间的工作情况，从而误判您为旷工。此时，您可以与公司人力资源部门或直接上级沟通，提供休假期间工作的证据（如工作邮件、聊天记录等），以证明您的实际情况。
公司管理错误：公司可能因管理疏忽或错误，将您的休假记录误标为旷工。这种情况下，您可以要求公司核查休假记录，并出具正式的书面说明，纠正错误记录。
故意为之：虽然不常见，但也不能排除公司因某种原因故意将您认定为旷工的可能性。若您怀疑公司存在此类行为，可以收集相关证据（如休假申请、批准记录、工作证据等），并通过法律途径维护自己的权益。
三、法律建议
保留证据：无论何种情况，您都应保留好休假申请、批准记录以及休假期间工作的相关证据。这些证据在后续与公司沟通或法律诉讼中都将起到关键作用。
与公司沟通：首先尝试与公司进行友好沟通，说明情况并提供证据。大多数情况下，公司会在了解真相后纠正错误。
寻求法律援助：若与公司沟通无果，或您怀疑公司存在故意行为，可以寻求法律援助。作为专业律师，我可以为您提供法律咨询和代理服务，帮助您维护自己的合法权益。
四、可能的法律后果
若公司坚持错误认定您为旷工，并据此进行处罚（如扣发工资、解除劳动合同等），您有权通过法律途径要求公司承担相应责任。根据《劳动合同法》等相关法律法规，公司因错误认定旷工而给劳动者造成损失的，应承担赔偿责任。
最后，我建议您先与公司进行友好沟通，说明情况并提供证据。若问题无法得到妥善解决，可以随时向我咨询，我将为您提供专业的法律支持和帮助。