员工想休年假但公司不批准，员工自行休假后公司以此辞退员工，这一行为是否合法需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：

1. 员工享有合法休假权利且程序合规

若员工依据法律法规或劳动合同约定享有休假权利，比如符合休年假的条件，且已按照公司规定的程序申请休假，但公司无故拒绝批准，员工在此情况下自行休假，公司以此为由辞退员工，通常是不合法的。这属于用人单位违反劳动法规，侵害员工合法权益的行为。员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付违法解除劳动合同的赔偿金，赔偿金标准为经济补偿标准的二倍，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。

2. 员工无合法休假依据或程序不合规

• 无合法休假依据：若员工并无合法的休假依据，比如未满足休年假的条件，却擅自休假，且经用人单位多次催告仍不返回工作岗位，用人单位基于合理的规章制度进行辞退，一般是合法的。因为员工违反了用人单位的管理秩序。
• 程序不合规：即使员工有一定休假理由，但未遵循用人单位的请假流程，比如未提前告知或未按照公司规定的程序申请休假，用人单位在给予相应警告或处分后，以员工严重违反规章制度为由辞退，在规章制度合理且公示告知员工的情况下，也可能被认定为合法。

3. 规章制度的有效性和执行的公正性

判定休假未批准辞退是否合法，关键还在于用人单位规章制度的有效性和执行的公正性。如果用人单位的规章制度未经民主程序制定或未公示告知员工，或者执行过程中存在不公正、不合理的情况，那么以此为依据辞退员工可能被认定为违法。

建议

• 对于员工：在申请休假前，应仔细了解公司的规章制度和请假流程，确保自己的休假申请符合规定。如果公司拒绝批准休假申请，应与公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。如果公司违法辞退员工，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
• 对于公司：应制定合理、公正的规章制度，并确保规章制度的民主程序制定和公示告知。在处理员工休假申请时，应遵循法律法规和公司规章制度的规定，确保处理的公正性和合理性。如果员工存在违规行为，公司应依法进行处理，并确保处理过程的合法性和正当性。

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