借调员工的工资一般由原单位发放，但具体发放主体需根据借出单位与借调单位之间的约定来确定。以下是对此问题的详细分析：

一、工资发放的一般原则

在大多数情况下，借调员工的工资应由借出单位（即原单位）发放。这是因为借调仅改变了员工的工作地点和任务，其人事关系和劳动关系依然保留在借出单位。借出单位应按照正常的工资发放流程，为借调员工支付工资、奖金、福利等各项薪酬待遇，并负责缴纳社保等费用。

二、协商约定的特殊情况

1. 由借调单位发放：

   • 在某些情况下，借出单位与借调单位会协商约定，借调期间借调员工的工资由借调单位承担。这通常是因为借调员工参与借调单位的特定项目或工作，且该工作对借调单位具有重要意义，或者借调单位有相关的经费安排来支持借调员工的薪酬。
   • 此时，借调单位将按照双方协商的方式和标准向借调员工发放工资。

2. 部分补贴由借调单位发放：

   • 还存在一种情况，即借出单位发放基本工资，而借调单位根据借调员工的工作情况发放额外补贴。
   • 这种补贴通常是对借调员工在借调期间额外工作付出的一种补偿，旨在激励借调员工更好地完成工作任务。

三、保障借调员工的合法权益

无论工资由哪方发放，都应确保借调员工的合法权益得到充分保障。这包括但不限于工资待遇、工作时间、休息休假以及社会保险等各方面权益。如果因为借调关系导致员工的合法权益受到损害，员工有权依法向相关部门投诉或寻求法律援助。

四、实际操作建议

• 明确约定：在实际操作中，建议借出单位与借调单位在借调协议中明确约定工资发放的相关事宜，包括工资发放的主体、方式、标准以及时间等，以避免潜在的纠纷和风险。
• 保留证据：借调员工应保留好与工资发放相关的证据，如工资条、银行转账记录等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
• 及时沟通：如果借调员工在工资发放方面遇到问题，应及时与借出单位和借调单位进行沟通，寻求解决方案。

总结来看，借调员工的工资发放主体及方式需根据借出单位与借调单位之间的具体约定来确定。在一般情况下，工资由借出单位发放；但在特殊情况下，也可能由借调单位全部或部分承担。无论如何，都应遵循法律法规，确保借调员工的合法权益得到妥善保护。如果您在借调工资发放方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。