结论前置：员工不明原因感染病毒，一般情况下公司无需承担医疗费赔偿责任，但特定情形下公司可能需要承担一定责任。
详细分析：
一般情况下的责任划分：
- 在大多数情况下，员工感染病毒（尤其是非职业病或非因工作原因导致的感染）并不属于工伤范畴。根据《工伤保险条例》的规定，工伤通常指的是在工作过程中因工作原因受到的事故伤害或患职业病。因此，如果员工感染病毒并非由于工作原因或工作环境导致，那么公司通常无需承担医疗费赔偿责任。
特定情形下的责任：
- 公司未提供安全工作环境：如果公司未能提供符合卫生标准的工作环境，或者未采取必要的预防措施（如定期消毒、提供防护用品等），导致员工在工作中感染病毒，那么公司可能需要承担一定的责任。这种情况下，员工可以依据相关法律法规（如《劳动法》、《安全生产法》等）要求公司承担相应的赔偿责任。
- 公司存在过错：如果公司明知员工可能感染病毒（如员工有接触史或出现症状），但未采取及时措施（如隔离、送医等），导致病毒在公司内部传播或造成更严重的后果，那么公司也可能需要承担责任。这种情况下，公司可能面临行政处罚或民事赔偿。
法律建议：
- 员工方面：如果员工认为自己感染病毒与公司有关，建议首先收集相关证据（如工作环境照片、同事证言、医疗记录等），然后与公司协商解决。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 公司方面：公司应加强对工作环境的卫生管理，定期消毒、提供防护用品等，以降低员工感染病毒的风险。同时，公司应建立健全的应急预案，一旦发现员工感染病毒，应立即采取隔离、送医等措施，防止病毒传播。
可能的法律后果：
- 如果公司被认定存在过错或未提供安全工作环境，可能需要承担员工的医疗费、误工费等赔偿责任。此外，公司还可能面临行政处罚（如罚款、停业整顿等）。
总结与建议：员工不明原因感染病毒时，公司是否需要承担医疗费赔偿责任取决于具体情况。如果感染并非由于工作原因或工作环境导致，公司通常无需承担责任。但如果公司存在过错或未提供安全工作环境，可能需要承担一定的赔偿责任。因此，建议员工和公司都应加强相关法律法规的学习和了解，以便在发生纠纷时能够依法维护自己的权益。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。