孕期已绩效考评不合格扣工资，这一行为是否合理需分情况讨论：
不合法且不合理的情况：
- 缺乏合法依据：若公司没有明确的绩效考核制度，或者该制度未通过民主程序制定、未向员工公示，那么公司随意扣除怀孕女职工的绩效工资是不合法且不合理的。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，需经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定，同时公示或告知劳动者。
- 与工作表现无关：怀孕女职工若能按岗位要求正常完成工作任务，且工作表现未受怀孕影响，公司不得仅以怀孕为由扣除其绩效工资。根据《女职工劳动保护特别规定》第五条，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳降低其工资或与其解除劳动合同。这里的“工资”包括基本工资、绩效工资等构成劳动者收入的部分。
- 制度歧视：若绩效考核制度对怀孕女职工存在明显歧视或不公平之处，即使制度本身存在，也不得作为扣减怀孕女职工绩效工资的依据。此类情况同样违反相关法律法规对女职工的特殊保护原则。
可能具有合理性的情况：
- 未达到绩效标准：在合法有效的绩效考核制度下，若怀孕女职工确因身体原因无法按照既定工作标准和要求完成任务，导致绩效指标未达标，公司可依据制度扣除相应绩效工资。但此时需提供充分证据证明女职工未完成工作任务与绩效不达标的直接关联性。
- 工作岗位调整后的合理调整：若女职工怀孕后，经双方协商一致调整了工作岗位，且新岗位的绩效工资标准与原岗位不同，公司可按照新岗位的绩效制度核算并发放绩效工资。此调整应基于双方自愿和公平原则，并确保新岗位的绩效制度是合理且一贯执行的。
法律背景与建议：
- 法律背景：孕期女职工享有特殊的法律保护，包括工资报酬的全面保障。根据《女职工劳动保护特别规定》第五条和《中华人民共和国劳动法》第九十一条，用人单位不得因女职工怀孕而降低其工资，否则将面临劳动行政部门的责令支付工资报酬及赔偿金的处罚。
- 建议：
- 与公司协商：首先尝试与公司友好沟通，要求说明扣除原因并出示考核依据。通过协商，可能解决问题。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向劳动监察部门投诉，寻求政府帮助和支持。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：若上述途径均无法解决问题，女职工可向劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，需提供充分证据证明自己的工作表现和用人单位的无故扣除行为。
可能的法律后果：
- 若公司无故扣除怀孕女职工的绩效工资，且无法提供合法合理的依据，将面临劳动行政部门的处罚，包括责令支付工资报酬及赔偿金。
- 女职工有权通过法律途径维护自己的合法权益，包括申请劳动仲裁或提起诉讼。若胜诉，公司需承担相应的法律责任，包括支付拖欠的工资、赔偿金等。
综上所述，孕期已绩效考评不合格扣工资是否合理，取决于具体的绩效考核制度以及女职工的实际工作情况。女职工在面临此类问题时，应积极了解自己的权益，并通过合法途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。