绩效考核不合格被扣绩效工资是否合法，需根据具体情况判断，符合一定条件时合法，违反相关法律法规或劳动合同约定时则非法。以下从合法与非法两种情形进行详细分析：

合法情形

1. 明确的规章制度与民主程序：

   • 用人单位必须依法制定绩效考核制度，并经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定。这一过程中需充分听取并考虑员工意见，确保制度的合理性和公正性。
   • 规章制度应明确规定绩效考核的标准、方式及绩效工资扣减的具体情形和比例，且这些规定不得违反法律法规的强制性规定。例如，若制度规定“季度考核不达标者，绩效奖金按50%发放”，且该制度经过民主程序制定并公示，则以此为依据扣减绩效工资是合法的。

2. 劳动合同中的明确约定：

   • 劳动合同中应明确载明绩效工资与绩效考核结果的挂钩关系，包括具体的挂钩方式和扣减情形。
   • 若劳动合同中有此类约定，且用人单位能证明员工绩效未达标，则按照合同约定扣减绩效工资通常是合法的。例如，劳动合同中约定“员工月度绩效考核未达标，将扣减当月绩效工资的20%”，且用人单位能提供员工绩效未达标的证据，则扣减行为合法。

3. 合理的绩效考核标准与证据支持：

   • 绩效考核标准应设定得合理、明确，不超出员工正常能力范围，且易于理解和执行。
   • 用人单位需有充分的证据证明员工的绩效确实未达到考核标准，如员工签字确认的绩效评估表、工作任务完成记录等。这些证据应真实、客观，能够反映员工的工作表现。

4. 扣除后工资不低于最低工资标准：

   • 即使扣除绩效工资，劳动者的工资收入也不得低于当地最低工资标准。这是保障劳动者基本生活权益的重要底线。例如，若员工的基本工资为当地最低工资标准，用人单位则无权再扣减绩效工资。

非法情形

1. 缺乏制度依据或未经民主程序：

   • 若用人单位没有相关的绩效考核制度，或虽有制度但未经法定的民主程序制定，则随意以绩效考核为由扣绩效工资是不合法的。例如，用人单位未经职工代表大会讨论，单方面制定绩效考核制度并扣减员工绩效工资，该行为违法。

2. 考核标准不合理或不明确：

   • 绩效考核标准若设定得过于苛刻、不合理，或模糊不清，使员工无法明确知道如何达到考核要求，则以此为依据扣减绩效工资是不合法的。例如，考核标准中规定“员工需完成不可能完成的任务”，并以此为由扣减绩效工资，该行为违法。

3. 滥用绩效考核扣工资：

   • 用人单位不得以绩效考核为手段进行恶意扣减或无故克扣工资。例如，为降低成本而故意将大部分员工评定为不达标并扣绩效工资，这种行为是违法的。

4. 劳动合同或规章制度无相关约定：

   • 若劳动合同或企业规章制度中没有明确约定绩效工资，或用人单位单方面从原有固定工资中拆分出一部分作为绩效工资，则无权以绩效考核为由扣除绩效工资。例如，劳动合同中未约定绩效工资，用人单位却从员工工资中扣减一部分作为绩效工资，并以此为由进行扣减，该行为违法。

劳动者权益保护建议

• 与用人单位协商：若认为用人单位绩效考核扣绩效工资的行为不合法，首先应尝试与用人单位进行协商沟通，表达自己的诉求和理由。
• 向劳动监察部门投诉：协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
• 申请劳动仲裁：若投诉无果，可向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

总结来说，绩效考核不合格被扣绩效工资是否合法，需根据用人单位的规章制度、劳动合同的约定以及考核标准的合理性、透明性和合法性来判断。作为劳动者，应了解自己的权益，并在遇到不合法扣罚时及时采取措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。