怀孕期间公司因业绩扣工资，在大多数情况下是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：

法律明确规定保护孕期女职工

根据《中华人民共和国劳动法》和《女职工劳动保护特别规定》，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动（聘用）合同。这一规定明确保障了女职工在特殊生理时期的合法权益，确保她们的工资待遇不会因怀孕而受到影响。

合法与不合法的情形辨析

1. 合法情形：

   • 理论上，公司可以依据合法有效的业绩考核制度来扣减工资，但这必须满足一系列严格条件。例如，制度需要经过民主程序制定、向员工公示，且扣减标准必须合理。然而，在实际操作中，这些条件往往难以完全满足，特别是当涉及到孕期女职工时。

2. 不合法情形：

   • 制度本身不合法：如果业绩考核制度未经民主程序制定或未向员工公示，那么公司依据该制度扣减工资的行为就是无效的。
   • 变相辞退或降薪：公司可能以业绩不达标为由故意提高考核标准，使怀孕女职工难以完成，进而扣减工资。这种行为实质上是变相降低工资，属于违法行为。
   • 业绩考核与怀孕相关：如果公司未考虑女职工怀孕的客观情况，按照非孕期相同标准进行考核并扣工资，同样是不合理且不合法的。

产检时间视为工作时间

怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，应算作劳动时间，不应扣除薪酬。这是对孕期女职工额外保护的一项具体措施，确保她们在产检期间不会因请假而影响工资收入。

维权途径

如果女职工遭遇因业绩扣工资的情况，可以采取以下措施来维护自己的权益：

1. 与公司协商：首先尝试与公司沟通，要求恢复被扣减的工资。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉举报，由其对公司的违法行为进行查处并责令改正。
3. 申请劳动仲裁或法院支付令：如问题仍未解决，可申请劳动仲裁，要求公司支付工资差额、赔偿金等。同时，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，劳动者还可以依法向当地人民法院申请支付令。

总结

综上所述，怀孕期间公司因业绩扣工资的行为，在绝大多数情况下都是违法的。女职工应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当措施进行维权。同时，公司也应遵守相关法律法规，确保孕期女职工的合法权益得到充分保障。如果女职工在孕期遇到任何与工资相关的问题，都应积极寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。