结论前置：

1. 公司发现金工资本身不违法，但需确保工资支付的真实性和合法性，并依法履行社保缴纳义务。
2. 若被查到未依法缴纳社保，公司需按照规定补缴社保费用，并可能面临滞纳金和罚款。

详细分析：

一、公司发现金工资的合法性

公司选择以现金形式支付员工工资，这一行为本身并不违法。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，但并未限定支付方式必须为银行转账。因此，公司选择现金支付工资，只要确保工资支付的真实性和合法性，即工资数额真实反映了劳动者的工作成果和应得报酬，且支付过程符合相关法律法规，就是合法的。

然而，需要注意的是，现金支付工资可能带来一些管理上的不便和风险，如难以留存支付凭证、可能引发劳动纠纷等。因此，建议公司在条件允许的情况下，尽量采用银行转账等更为安全、便捷的支付方式。

二、未依法缴纳社保的补缴及合规处理

如果公司被发现未依法为员工缴纳社保，将面临一系列的法律后果。根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位未按时足额缴纳社会保险费的，由社会保险费征收机构责令其限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金；逾期仍不缴纳的，由有关行政部门处欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。

补缴社保的合规步骤如下：

1. 确认欠缴情况：公司应首先确认欠缴的社保费用种类、金额及欠缴时间，以便制定准确的补缴计划。

2. 制定补缴计划：根据欠缴情况，公司应制定详细的补缴计划，包括补缴时间、补缴金额及补缴方式等。

3. 与社保机构沟通：公司应主动与当地社保机构沟通，了解补缴的具体流程和要求，确保补缴工作的顺利进行。

4. 按时足额补缴：按照补缴计划，公司应按时足额补缴欠缴的社保费用，并缴纳相应的滞纳金。

5. 保留相关凭证：补缴完成后，公司应妥善保留相关凭证，如补缴通知书、缴费凭证等，以备查验。

三、建议与提醒

为了避免因未依法缴纳社保而引发的法律风险，建议公司：

1. 加强内部管理：建立健全的工资支付和社保缴纳制度，确保各项工作的合规性。

2. 定期自查：定期对公司的工资支付和社保缴纳情况进行自查，及时发现并纠正存在的问题。

3. 积极沟通：与当地社保机构保持密切沟通，及时了解相关政策法规的变化，确保公司的社保缴纳工作符合最新要求。

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