若员工在申请劳动仲裁前，公司已经改正了其违法行为，处理方式需分情况讨论：

1. 若员工已接受改正并放弃仲裁：

   • 在这种情况下，由于公司已经纠正了其不当行为，且员工对此表示接受，那么劳动仲裁的必要性就大大降低了。员工可以选择不继续进行仲裁程序，因为仲裁的主要目的通常是纠正违法行为并获得相应的补偿或赔偿。既然问题已经得到解决，继续仲裁可能不再必要。

2. 若员工仍坚持仲裁，但公司改正行为成为仲裁考量因素：

   • 即使员工决定继续仲裁，公司已经改正的行为也会成为仲裁庭在裁决时考虑的一个重要因素。仲裁庭可能会认为，既然公司已经采取了纠正措施，那么员工所要求的某些补偿或赔偿可能不再适用或需要调整。例如，如果员工原本要求公司支付因违法行为导致的工资损失，但公司已经补发了工资，那么仲裁庭可能不会支持员工这一部分的诉求。
   • 法律依据：根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，仲裁庭在裁决劳动争议案件时，会综合考虑双方当事人的陈述、证据以及相关法律法规。公司改正行为的事实，无疑会成为仲裁庭裁决时的重要参考。

3. 若员工仲裁请求包含非改正行为可弥补的损失：

   • 如果员工的仲裁请求中包含了即使公司改正行为也无法完全弥补的损失，如精神损害赔偿、因违法行为导致的长期职业影响等，那么员工仍然有权在仲裁中提出这些诉求。仲裁庭会根据具体情况，判断这些诉求是否合理，并作出相应的裁决。
   • 举例说明：假设员工因公司的违法行为遭受了精神上的严重打击，即使公司后来改正了行为并补发了工资，员工也可能要求公司支付精神损害赔偿。这种情况下，仲裁庭会综合考虑员工的实际损失、公司的过错程度以及相关法律法规，来裁决是否支持员工的精神损害赔偿请求。

建议：

• 对于员工而言，如果公司已经改正了违法行为，并且自己对此表示满意，那么可以考虑放弃仲裁，以节省时间和精力。
• 如果员工仍然认为自己的权益受到了侵害，并且有充分的证据支持自己的诉求，那么可以继续进行仲裁，但需要做好仲裁庭可能考虑公司改正行为因素的准备。
• 在任何情况下，都建议员工在决定是否继续仲裁前，咨询专业的法律人士，以获取更具体、更个性化的法律建议。

后续行动指南：

• 员工应仔细评估公司改正行为对自己权益的影响，以及自己是否仍然有合理的仲裁诉求。
• 如果决定继续仲裁，员工应准备充分的证据来支持自己的诉求，并了解仲裁程序和相关法律法规。
• 在整个过程中，员工都可以寻求专业法律人士的帮助，以确保自己的权益得到最大程度的保护。

有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况，提供更详细、更个性化的法律建议。