作为有丰富经验的律师，针对员工仲裁公司这一问题，核心结论是公司需积极应对，以下从不同阶段为你详细阐述处理方式：

仲裁前

1. 审查自身行为：公司首先要对引发仲裁的事项进行全面审查，比如是否真的存在未按时足额支付工资、未依法缴纳社保、违法解除劳动合同等违反劳动法律法规的行为。如果存在，评估问题的严重程度以及可能面临的法律后果，为后续应对做好准备。例如，若公司确实存在拖欠工资的情况，要核算拖欠的金额、涉及的员工人数等。
2. 收集证据：围绕仲裁事项收集相关证据，以证明公司的行为合法合规或者有合理的理由。证据类型包括但不限于劳动合同、工资支付记录、考勤记录、规章制度、员工违纪的证据等。比如，若公司以员工严重违反规章制度为由解除劳动合同，就要收集能证明员工违纪行为以及规章制度制定程序合法的证据。
3. 与员工沟通协商：在仲裁程序启动前，公司可以尝试与员工进行沟通协商，了解员工的诉求和想法，寻求和解的可能性。通过友好协商解决问题，不仅可以避免仲裁程序带来的时间和精力消耗，还能维护公司与员工之间的关系。例如，对于一些因误解产生的纠纷，通过沟通解释可能就能化解矛盾。

仲裁中

1. 按时提交答辩状和相关证据：在收到仲裁委员会送达的仲裁申请书副本后，公司要在规定的时间内（一般为10日）提交答辩状和相关证据。答辩状要针对员工的仲裁请求和事实理由进行回应，阐述公司的观点和主张。同时，要确保提交的证据真实、合法、有效，并且与案件具有关联性。
2. 参加仲裁庭审：公司要按照仲裁委员会通知的时间和地点参加庭审。在庭审过程中，要遵守庭审纪律，尊重仲裁员和对方当事人的权利。积极陈述公司的观点和理由，对员工提出的证据和主张进行质证和反驳。例如，对于员工提供的虚假证据，要及时指出并提供相反的证据予以证明。
3. 尊重仲裁裁决：仲裁庭作出裁决后，公司要尊重裁决结果。如果对裁决不服，在符合法定条件的情况下，可以在规定的时间内（一般为收到裁决书之日起15日）向人民法院提起诉讼。

仲裁后

1. 履行裁决义务：如果仲裁裁决公司承担相应的义务，如支付工资、经济补偿等，公司要按照裁决的要求及时履行。否则，员工可以向人民法院申请强制执行，这会给公司带来更严重的法律后果和不良影响。
2. 总结经验教训：无论仲裁结果如何，公司都要对整个事件进行总结反思，分析公司在劳动用工管理方面存在的问题和不足，及时完善规章制度，加强劳动法律法规的培训和学习，避免类似纠纷的再次发生。

如果公司在处理员工仲裁问题过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律指导，都可以直接向我咨询。