进入单位若单位本身不合法，一般不能直接通过该单位申报职称，但具体需视情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、单位不合法对职称申报的影响
职称申报的基本条件：
- 职称申报通常要求申报人所在单位为合法注册、运营的单位，因为职称评审机构需要确认申报人的工作经历、业绩成果等信息的真实性。
- 若单位不合法，如未进行工商注册、存在违法经营行为等，其出具的证明材料可能无法被职称评审机构认可。
单位不合法可能导致的后果：
- 申报材料可能被退回或不予受理，导致申报人无法参与职称评审。
- 即使申报材料被受理，若后续发现单位不合法，申报人的职称评审结果也可能被撤销。
二、不同情况下的处理建议
若单位确实存在不合法行为：
- 建议申报人暂停通过该单位申报职称，以免浪费时间和精力，甚至可能面临法律风险。
- 申报人应尽快寻找合法单位进行工作交接或重新就业，并在新单位符合职称申报条件时，再行申报。
若单位存在误解或信息不准确导致“不合法”的认定：
- 申报人应积极与单位沟通，澄清误解，提供准确信息，以证明单位的合法性。
- 若沟通无果，申报人可向相关监管部门投诉或举报，要求对单位进行合法性审查，并在审查结果明确后，再行考虑职称申报事宜。
特殊情况下的处理：
- 若申报人已离开不合法单位，但希望保留职称申报资格：申报人应尽快将个人档案、工作成果等材料转移至合法单位或人才交流中心，并咨询当地职称评审机构，了解是否可以通过其他途径进行职称申报。
- 若申报人因单位不合法而遭受损失：如工资拖欠、社保未缴等，申报人可依法向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自身合法权益。
三、法律背景与建议
- 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位应依法注册、运营，保障劳动者的合法权益。若用人单位存在不合法行为，劳动者有权依法维权。
- 建议：申报人在选择就业单位时，应仔细核查单位的合法性，避免陷入不必要的法律纠纷。同时，在职称申报过程中，应确保所有申报材料的真实性和合法性，以免影响评审结果。
若您在职称申报或劳动法律方面遇到任何问题，欢迎直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。