针对您提出的“不配合办理出生证明是否可以起诉对方”的问题，这实际上涉及到一个较为复杂的情境，因为“不配合”可能源于多种原因，且直接起诉并非总是最恰当或最有效的解决方式。以下是我为您提供的详细分析和建议：
一、分析不配合的原因
首先，我们需要明确“不配合”的具体原因。这可能是由于：
- 行政机关或医疗机构的不作为或违规操作：如故意拖延、设置不合理条件等。
- 自身材料不齐全或不符合要求：导致无法满足办理出生证明的条件。
- 存在法律纠纷或特殊情况：如非婚生育、亲子关系存疑等。
二、针对不同原因的应对措施
行政机关或医疗机构的不作为或违规操作：
- 投诉途径：您可以向该部门的上级主管单位（如市级或省级卫生健康委）、当地的政务服务热线（如12345）或卫生健康监督部门进行投诉。
- 证据准备：提供办理过程中的时间记录、对话记录或书面拒绝材料等，以证明行政部门或医疗机构的不作为或违规操作。
- 起诉考虑：在投诉无果或情况严重的情况下，您可以考虑咨询专业律师，了解是否具备起诉的条件和可能性。
自身材料不齐全或不符合要求：
- 建议：在这种情况下，起诉并非明智之举。您应首先按照办理机构的要求，尽快补齐或更正材料。
- 沟通：与办理机构保持沟通，了解具体需要哪些材料，以及如何正确提交。
存在法律纠纷或特殊情况：
- 建议：涉及非婚生育、亲子关系存疑等特殊情况时，应先与相关部门沟通，了解具体解决方案。
- 法律程序：按照法律程序进行处理，如进行亲子鉴定、解决法律纠纷等。
- 法律援助：如有需要，可以寻求专业法律人士的帮助，以更好地维护自己的权益。
三、起诉的考虑因素
在决定是否起诉之前，您需要考虑以下因素：
- 证据充分性：您是否有足够的证据证明对方的不配合行为，以及这种行为对您造成的损害。
- 法律程序复杂性：起诉可能涉及复杂的法律程序，包括准备诉状、提交证据、参加庭审等。
- 时间和成本：起诉可能需要花费大量的时间和金钱，您需要评估这是否值得。
- 替代解决方案：在起诉之前，您是否尝试过其他替代解决方案，如投诉、协商等。
四、结论
综上所述，不配合办理出生证明是否可以起诉对方，取决于具体的原因和情境。在大多数情况下，起诉并非首选解决方案。您应首先尝试与办理机构沟通解决问题，或通过投诉等合法途径维护自己的权益。如果确定是办理机构存在严重违规或不作为的情况，且其他途径无法解决问题时，您可以考虑咨询专业律师，了解起诉的具体条件和可能性。