即使店门关闭且员工已离职，如果离职合同中存在处理不公的情况，员工仍然有权与店里就此事进行协商。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 离职合同的法律效力

1. 合同内容应公平合理：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同（包括离职合同）的内容应当公平、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。如果离职合同中存在显失公平或违法的条款，员工有权请求变更或撤销。
2. 合同是双方协商一致的产物：离职合同应是员工与用人单位在平等、自愿的基础上协商一致的结果。如果店里在离职合同的处理上存在不公，员工有权提出异议并要求重新协商。

二. 员工与店里的协商权利

1. 协商是解决问题的途径：尽管店门已关闭，但如果离职合同中的问题尚未解决，员工仍有权与店里进行协商，以期达成双方都能接受的解决方案。
2. 协商不成可寻求法律途径：如果协商无果，员工可以依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼。

三. 实际操作的建议

1. 准备充分的证据：在与店里协商前，员工应收集好与离职合同相关的所有证据，如合同文本、沟通记录、支付凭证等，以便在协商过程中有力地支持自己的主张。
2. 明确自己的诉求：员工应清晰、明确地表达自己的诉求，是要求修改离职合同中的不公条款，还是要求店里支付应得的款项等。
3. 保持冷静和理性：在协商过程中，员工应保持冷静和理性，避免情绪化的言辞和行为，以有助于双方达成和解。

综上所述，即使店门关闭且员工已离职，员工仍有权与店里就离职合同中的不公问题进行协商。我建议员工在协商前做好充分的准备，明确自己的诉求，并保持冷静和理性。如协商无果，员工可以依法向相关部门申请调解、仲裁或提起诉讼。如有进一步需要，您可以继续咨询我。