结论：招标文件中未明确中标金额时，履约保证金的约定需结合项目性质、风险评估及法律规定，通过以下方式明确条款：

1. 按合同总价比例约定
   若项目为固定总价合同，可约定履约保证金为合同总价的5%-10%（常见比例，具体需根据行业惯例调整）。例如：

   “承包人应在合同签订后5日内，按合同总价的8%向发包人提交履约保证金，形式为银行保函或现金。”
   法律依据：《民法典》第586条（定金数额不得超过主合同标的额的20%，但履约保证金非定金，比例可更高）。

2. 按项目阶段或里程碑分阶段约定
   若项目为分期实施或存在关键节点，可按阶段比例提交保证金。例如：

   “承包人应在合同签订后提交合同总价5%的保证金；完成第一阶段工程后，返还50%；全部工程验收合格后返还剩余部分。”
   优势：降低承包人资金压力，同时保障发包人阶段性风险控制。

3. 设定固定金额（需合理评估风险）
   若项目金额难以预估（如成本加酬金合同），可设定固定金额保证金，但需符合以下条件：

   • 合理性：金额应与项目风险匹配（如工程复杂度、工期、违约后果）；
     
   • 上限限制：避免过高金额被认定为“显失公平”（司法实践中，超过合同总价20%的部分可能被调整）。
     示例条款：
     > “承包人应提交人民币50万元履约保证金，该金额为发包人根据项目风险评估后确定，不因合同总价调整而变更。”
     

4. 结合担保形式降低资金占用
   允许使用银行保函、担保公司保函等非现金形式，减少承包人资金压力。例如：

   “履约保证金可采用不可撤销的银行保函形式，保函有效期至工程竣工验收合格后30日。”
   法律依据：《招标投标法实施条例》第58条（允许以保函替代现金）。

风险提示：

• 若未约定中标金额且未明确保证金计算方式，可能引发争议（如承包人主张比例过高）；
  
• 建议在招标文件中增加“若合同总价调整，保证金按比例同步调整”的条款，避免后续纠纷。
  

操作建议：

1. 优先选择比例约定（如合同总价5%-10%），兼顾灵活性与风险控制；
   
2. 明确保证金返还条件（如验收合格、无违约行为等）；
   
3. 禁止约定“保证金不予退还”等霸王条款，否则可能被认定为无效。
   

如有具体项目类型或合同条款需进一步细化，可直接向我咨询。