单位将跑步与工资挂钩是否违法，需分情况讨论：
若单位无明确合理依据和约定，直接挂钩则违法
- 根据现行劳动法律，工资必须以法定货币形式，每月按时发放至劳动者手中，用人单位不得无故扣除或逾期拖欠。若单位仅因员工未参与跑步活动，便直接扣减工资，且无劳动合同或规章制度中的明确约定作为支撑，此行为显然违反了劳动法关于工资支付的规定。
- 举例来说，若小张所在单位突然规定，每月必须参加三次跑步活动，否则扣减当月工资的10%，而此规定并未在劳动合同或公司规章制度中明确，且未经过合法程序制定，那么小张有权对此提出异议，并可通过法律途径维护自己的权益。
若劳动合同或规章制度中有明确合理规定，且遵循法律程序，则可能合法
- 如果单位在劳动合同或公司规章制度中，明确规定了跑步活动与工资挂钩的具体条款，如“员工每月需参加至少两次跑步活动，作为健康管理的一部分，未参与者将扣减当月绩效奖金的5%”，并且此规定经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），且已向劳动者公示或告知，那么此类做法可能被视为合法。
- 但需注意，即便是合法，单位也应确保跑步活动的安排合理，不侵犯员工的休息权和其他合法权益。例如，跑步活动应在工作时间之外进行，且不应成为员工的主要工作压力来源。
法律建议：
- 建议您首先查阅与公司签署的劳动合同以及公司相关规章制度，确认其中是否有关于跑步活动与工资挂钩的具体条款。
- 若发现单位的行为违反了劳动法规定，您有权通过法律途径维护自己的权益，如向劳动争议仲裁机构申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。
- 在处理此类纠纷时，建议您保留好相关证据，如工资条、跑步活动记录、公司规章制度等，以便在需要时提供证明。
可能后果：
- 若单位的行为被认定为违法，除了需补发被扣减的工资外，还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。
- 对于员工而言，若因单位违法行为导致权益受损，还有权要求单位承担赔偿责任，包括但不限于工资损失、精神损害抚慰金等。
总之，单位将跑步与工资挂钩是否违法，需根据具体情况判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。