工伤不认定，一般情况下不能直接就停工留薪期工资申请劳动仲裁。因为工伤认定是确定工伤的必经之路，也是争取工伤权益（包括停工留薪期工资）的基础。以下是对此问题的详细分析：
一、工伤认定与停工留薪期工资的关系
工伤认定是前提：
- 停工留薪期工资是工伤职工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付的待遇。而停工留薪期的确定，通常是以工伤认定为前提的。
- 如果工伤未被认定，那么从法律意义上讲，就不存在停工留薪期，因此也就无法直接申请劳动仲裁要求支付停工留薪期工资。
实际中的协商与仲裁：
- 在实际中，如果用人单位认同工伤事实，并且双方能够协商一致，那么可能会有类似停工留薪期的待遇安排。但这种情况并不具有法律强制性，且容易引发争议。
- 如果协商不成，职工可以尝试向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。但仲裁的成功与否，很大程度上取决于职工手中掌握的证据以及实际情况。
二、工伤不认定时的应对策略
尽快申请工伤认定：
- 如果职工认为自己所受伤害属于工伤，那么应尽快准备相关材料，向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 申请工伤认定的期限一般为事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内。超过这个期限，除非存在不可抗力等特殊情况，否则劳动保障行政部门可能不会受理。
收集证据以备仲裁或诉讼：
- 在申请工伤认定的同时，职工应积极收集与工伤相关的各种证据，如事故现场照片、医院诊断证明、同事证言等。
- 这些证据不仅有助于工伤认定的成功，也能在后续的仲裁或诉讼中发挥重要作用。
考虑其他劳动争议的仲裁：
- 如果工伤未被认定，但职工与用人单位之间存在其他劳动争议（如工资发放、确认劳动关系等），那么职工可以单独就这些争议申请劳动仲裁。
- 这种情况下，仲裁请求与工伤认定无直接关联，因此不受工伤认定结果的影响。
三、法律建议
- 及时行动：职工在遭受工伤后，应尽快采取行动，包括申请工伤认定、收集证据等。拖延时间可能会导致证据丢失或超过申请期限等不利后果。
- 咨询专业律师：虽然我作为高和利律师在这里为你提供解答，但每个案件的具体情况都有所不同。如果你在处理工伤认定或劳动仲裁过程中遇到复杂问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。
综上所述，工伤不认定时，一般情况下不能直接就停工留薪期工资申请劳动仲裁。但职工可以通过尽快申请工伤认定、收集证据以及考虑其他劳动争议的仲裁等方式来维护自己的合法权益。