买卖合同中每日万分之二的违约金并不必然超过法定标准，是否合法需结合具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同约定优先原则
根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，合同双方可以基于平等自愿的原则，在合同中明确约定违约金的具体数额或计算方式，包括每日万分之二的违约金比例。只要该约定不违反法律法规的强制性规定，且不存在明显不公平、不合理的情形，就具有法律效力。因此，如果买卖合同中双方明确约定了每日万分之二的违约金，且该约定符合上述条件，那么这一比例就是合法的。
二、实际损失为基础原则
在合同未明确约定或约定的违约金数额显失公平时，违约金的计算应以因违约行为造成的实际损失为基础。一般来说，每日的违约金金额不应超过因违约行为造成的实际日损失的百分之三十。如果每日万分之二的违约金比例，在具体案件中未超过实际日损失的百分之三十，那么这一比例就是合理的。反之，如果超过了这一比例，且违约方提出异议，法院或仲裁机构可能会根据实际情况对违约金进行调整。
三、司法调整机制
如果约定的违约金过高或过低，当事人有权请求人民法院或仲裁机构进行适当调整。法院或仲裁机构在判断是否过高或过低时，会综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度、预期利益以及违约行为的性质、目的等多个因素，并根据公平原则和诚实信用原则作出裁决。因此，即使合同中约定了每日万分之二的违约金，如果在实际执行中出现问题，也可以通过司法途径进行调整。
四、实际操作建议
明确约定：为了避免后续纠纷，建议在合同中明确约定违约金的具体数额或计算方式，包括每日万分之二的违约金比例，并确保该约定不违反法律法规的强制性规定。
综合判断：在设定或调整违约金时，应综合考虑合同的性质、目的、履行情况以及违约行为的具体情节等因素，确保违约金的设定既符合法律法规的要求，又能够体现合同的公平性和合理性。
及时寻求法律救济：如果认为约定的违约金过高或过低，或者在实际执行中遇到问题，应及时向人民法院或仲裁机构提出请求，以便通过法律程序进行调整。
五、示例分析
假设在一份买卖合同中，双方约定了每日万分之二的违约金比例。如果因卖方延迟交货给买方造成了每日1000元的损失，而按照每日万分之二的违约金比例计算，每日违约金为合同总金额的万分之二（假设合同总金额为50万元，则每日违约金为100元）。在这种情况下，每日100元的违约金显然未超过实际日损失1000元的百分之三十，因此这一比例是合理的。反之，如果实际日损失远低于按每日万分之二计算的违约金，那么违约方可以请求法院或仲裁机构对违约金进行调整。
综上所述，买卖合同中每日万分之二的违约金并不必然超过法定标准，其合法性需结合合同约定、实际损失以及相关法律法规进行综合判断。如果您在买卖合同中遇到违约金相关的问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。