针对您提出的“公司从员工工资里扣商业保险是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，根据我国现行的劳动法律法规，雇佣机构（即公司）是不得擅自克扣或无理拖欠员工薪资待遇的。这意味着，公司没有法定权利直接从员工的工资中扣除任何费用，除非有明确的法律规定或双方有明确的合同约定。
对于商业保险的扣除，关键在于是否得到了员工的明确同意，并且这种扣除是否符合相关的法律法规。如果公司希望为员工购买商业保险，并希望从员工工资中扣除相应费用，那么必须满足以下条件：
员工同意：公司必须事先获得员工的明确同意，员工应知晓并同意从其工资中扣除商业保险费用。
合同约定：这种扣除应在劳动合同或相关协议中有明确约定，包括扣除的金额、方式、时间等具体细节。
合法合规：扣除的商业保险费用必须符合国家相关法律法规的规定，不能违反任何法律条款。
如果公司未经员工同意，或未在劳动合同中明确约定，就擅自从员工工资中扣除商业保险费用，那么这种行为是违法的。员工有权向劳动监察部门投诉，并要求公司返还被扣除的费用。
此外，我还想提醒您，如果公司扣除了您的个人所得税但未依法缴纳，您同样有权向税务机关投诉举报。税务机关将依法进行调查处理，并维护您的合法权益。
综上所述，公司从员工工资里扣商业保险是否合法，关键在于是否得到了员工的明确同意，并且这种扣除是否符合相关的法律法规和合同约定。如果您对此有任何疑问或担忧，建议您及时与公司沟通，并咨询专业的法律人士以获取更详细的法律建议。