弹性工作制下，企业违法让员工加班的情况确实可能存在，关键在于是否超出了法定工作时间且未支付相应加班费。以下是对此问题的详细分析：
一、弹性工作制的定义与法律约束
弹性工作制允许员工在完成规定的工作任务或固定的工作时间长度的前提下，灵活地、自主地选择工作的具体时间安排。然而，这种灵活性并不意味着企业可以无视劳动法的规定，随意要求员工加班而不支付加班费。
二、违法加班的情形
未经审批的不定时工作制下的违法加班：
- 如果企业未经劳动行政部门审批就自行实行不定时工作制（或类似弹性工作安排），并要求员工在正常工作时间以外加班而不支付加班费，这是违法的。因为，未经审批的不定时工作制并不具备法律效力，企业仍需按照标准工时制来考量工作时间和加班费支付。
超出法定工作时间的加班：
- 即使企业实行了经审批的不定时工作制，如果员工在法定节假日或休息日仍被要求工作，且企业未按照法律规定支付相应的加班工资（如法定节假日不低于工资的300%，休息日不低于工资的200%），这也构成违法。
三、加班费的支付条件与法律依据
- 超出正常工作时间的劳动：在弹性工作时间内，如果员工超出正常工作时间仍在为公司工作，且这些工作与正常工作任务相关，公司应支付加班费。
- 法定节假日或休息日的工作：即使实行弹性工作制，员工在法定节假日或休息日工作，公司也必须按照法律规定支付加班费。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第三十一条，用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。
四、员工权益保护措施
如果劳动者怀疑自身权益受到侵害，即企业在弹性工作制度下未按规定支付加班费，可以采取以下措施：
- 与用人单位沟通：首先尝试与用人单位进行沟通，明确表达自己的诉求和依据，看是否能够协商解决。
- 向劳动监察部门投诉：若沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：劳动者还可以申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
举例说明：假设某公司实行弹性工作制，但未经劳动行政部门审批。公司要求员工在周末加班完成一项紧急任务，却未支付加班费。这种情况下，员工有权要求公司支付加班费，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
综上所述，弹性工作制并不意味着企业可以违法让员工加班。员工应了解自己的工时制度和加班权益，并在必要时采取相应措施维护自己的合法权益。如果你有任何关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，都可以直接向我咨询。