结论：弹性工作制下是否可以主张加班费，需根据具体情况判断，主要包括工时制度类型、实际工作时间以及是否经过合法审批等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、不同工时制度下的加班费情况
不定时工作制：
- 通常无加班费：如果企业实行的是经劳动行政部门审批的不定时工作制，劳动者在法定标准工作时间以外工作，通常情况下用人单位无需支付加班工资。这类工时制度适用于工作时间不固定、工作机动性大的岗位，如高级管理人员、外勤人员等。
- 特殊规定例外：在法定节假日安排不定时工作制员工工作时，企业必须按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资。部分地区如上海，对法定节假日安排不定时工作制员工工作的，也有类似要求支付加班费的规定。
综合计算工时工作制：
- 可能存在加班费：在综合计算周期内，若劳动者实际工作时间总数超过法定标准工作时间总数，超出部分视为延长工作时间，应支付加班费，标准为不低于劳动者本人小时工资标准的150%。法定节假日工作的，加班费标准为不低于日或小时工资标准的300%。
非标准工时制（未经审批的弹性工作安排）：
- 如果企业未经劳动行政部门审批就自行实行弹性工作安排，实际上仍应按照标准工时制来考量工作时间。在这种情况下，如果安排劳动者在正常工作时间以外加班而不支付加班费，则是违法的。按照法律规定，平时延长工作时间的，需支付不低于工资150%的加班费；休息日安排工作又不能安排补休的，支付不低于工资200%的加班费；法定休假日安排工作的，支付不低于工资300%的加班费。
二、加班费的支付条件
超出正常工作时间的劳动：
- 在弹性工作时间内，如果员工超出正常工作时间仍在为公司工作，且这些工作与正常工作任务相关，那么公司应支付加班费。
法定节假日或休息日的工作：
- 即使实行弹性工作制，如果员工在法定节假日或休息日仍被要求工作，公司也必须按照法律规定支付相应的加班工资。
三、员工权益保护与建议
- 了解工时制度：员工应了解自己所在岗位实行的工时制度，以及该制度下加班费的支付规定。
- 保留证据：如果员工认为自己在弹性工作制下存在加班情况，应保留相关证据，如考勤记录、工作成果等，以便在必要时维护自己的合法权益。
- 沟通协商：首先与用人单位进行沟通，尝试协商解决加班费问题。
- 投诉与仲裁：若沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。劳动者还可以申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
示例说明：
假设某员工实行的是不定时工作制，且已经过劳动行政部门审批。在平时的工作日中，该员工的工作时间不固定，但通常不会超过法定标准工作时间。然而，在某个法定节假日，该员工被要求工作。根据法律规定，即使实行的是不定时工作制，该员工也有权获得不低于本人日或小时工资标准300%的加班费。
法律背景：
- 《工资支付暂行规定》第十三条明确规定了加班费的支付标准，包括工作日延长工作时间、休息日加班且不能补休、法定节假日加班等情形。
- 原劳动部《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》对不定时工作制和综合计算工时工作制的审批、实施及加班费支付等作出了具体规定。
后续行动建议：
如果你在弹性工作制下存在加班情况，且不确定是否可以主张加班费，建议首先了解自己的工时制度类型及加班费支付规定。如有需要，可以向我咨询具体法律问题，我会根据你的实际情况提供详细的法律建议。