弹性工作制下，休息日加班一般没有加班费，但具体需根据工时制度及实际情况判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、弹性工作制与加班费的一般原则
弹性工作制，通常指的是不定时工作制或综合计算工时工作制。在这两种制度下，加班费的支付与标准工时制有所不同。
不定时工作制：
- 定义：适用于因生产特点、工作特殊需要或职责范围关系，无法按标准工作时间衡量的职工。
- 加班费情况：实行不定时工作制的劳动者，因其工作时间不固定，一般不享受加班费。这是基于原劳动部《工资支付暂行规定》的相关规定，即不定时工作制的劳动者不执行加班费的相关规定。
- 特殊规定：然而，部分地区如上海，对法定节假日安排不定时工作制员工工作的，可能要求支付加班费。这需根据当地的具体规定来执行。
综合计算工时工作制：
- 定义：适用于因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业或部分职工，以周、月、季、年为周期综合计算工作时间。
- 加班费情况：在综合计算周期内，若劳动者实际工作时间总数超过法定标准工作时间总数，超出部分视为延长工作时间，应支付加班费。具体标准为不低于劳动者本人小时工资标准的150%。若在法定节假日工作，则加班费标准为不低于日或小时工资标准的300%。
二、休息日加班的具体分析
在弹性工作制下，休息日加班是否有加班费，主要取决于以下几点：
工时制度类型：
- 若为不定时工作制，且未经特殊规定（如上海地区对法定节假日的特殊规定），则休息日加班一般无加班费。
- 若为综合计算工时工作制，且在综合计算周期内实际工作时间超出法定标准，则超出部分应视为延长工作时间，需支付加班费。但需注意，这里的“休息日”若未超出综合计算周期内的法定工作时间总数，则可能不视为加班。
是否经过合法审批：
- 企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制，必须经过劳动行政部门的审批。未经审批擅自实行的，即使名义上是弹性工作制，一旦劳动者超时工作，单位仍需支付加班费。
实际工作时间：
- 无论何种工时制度，若劳动者的工作时间超出了每日8小时、每周40小时的法定标准工作时间（在综合计算工时工作制下为综合计算周期内的法定标准工作时间总数），单位均需按照法律规定支付加班费。
三、法律建议与风险提示
了解工时制度：
- 劳动者在入职前应了解企业实行的工时制度类型，以及是否经过劳动行政部门的审批。
保留工作证据：
- 劳动者应保留好工作时间的记录等证据，以备在发生纠纷时维护自己的合法权益。
及时咨询与维权：
- 若对加班费支付有疑问或发现单位未按规定支付加班费，劳动者应及时向单位提出或向劳动监察部门投诉。
作为黄兆麟律师，我提醒您，在处理劳动纠纷时，务必了解清楚自己的权益和单位的义务。如果您在弹性工时制下休息日加班但未获得加班费，或者对加班费支付有任何疑问，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。