在标准工时制下，周六日上班是否有加班工资的问题，确实需要依据具体的法律规定和实际情况来综合判断。以下是我为您提供的详细解答：
一、标准工时制下的基本规定
标准工时制是指劳动者每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过40小时的工时制度。根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，如果用人单位在休息日（即周六和周日）安排劳动者工作，并且不能安排补休，那么应当支付不低于工资的百分之二百的工资报酬作为加班工资。
二、加班工资的具体计算
计算基数：加班工资的计算基数一般按照劳动合同约定的劳动者本人工资标准确定。若劳动合同没有约定，则按照集体合同约定的加班工资基数及休假期间工资标准确定。若劳动合同和集体合同均未约定，则按照劳动者本人正常劳动应得的工资确定，但不得低于当地最低工资标准。
计算方式：以月工资为例，加班工资的计算通常是将员工的正常月工资除以21.75天（月计薪天数），得到日工资标准，再乘以200%（休息日加班倍数），即可得出周六日上班的加班工资。
三、补休与加班工资的关系
用人单位在安排劳动者在休息日工作时，应首先考虑安排补休。如果能够安排补休，则可以不支付加班工资。若不能安排补休，则必须按照法律规定支付加班工资。这是用人单位的一项法定义务，也是保障劳动者权益的重要措施。
四、特殊工时制下的情况
虽然您的问题主要关注标准工时制，但为了全面解答，我也简要介绍一下特殊工时制下的情况：
不定时工作制：对于实行不定时工作制的员工，如企业中的高级管理人员、外勤人员等，他们的工作时间不受固定时数限制。经劳动行政部门批准后，在周六日工作通常不被视为加班，因此没有加班工资。但如果在法定节假日工作，则应按规定支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
综合计算工时工作制：在这种工时制度下，以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间。如果在一个综合的工时考核周期内，劳动者的总实际工作时间不超过总法定标准工作时间，则周六日上班不被视为加班。若超过部分，应视为延长工作时间，并按规定支付150%的加班工资；在法定节假日工作的，则需支付300%的加班工资。
五、劳动者权益保护
作为劳动者，您应密切关注自身的加班及补休权益。如果用人单位违反相关规定，未依法支付加班工资或未安排补休，您有权首先与用人单位协商解决。协商不成的，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身的合法权益。
综上所述，在标准工时制下，周六日上班是否有加班工资主要取决于是否安排了补休。如果未安排补休，则用人单位应当支付不低于工资的百分之二百的工资报酬作为加班工资。希望这个解答能够帮助您更好地理解相关法律规定和自身权益。