工资退还是否合法，主要取决于具体情况和原因。以下是对此问题的详细分析：
一、合法退还工资的情形
工资计算错误：
- 如果公司能够证明在发放工资时存在计算失误，例如多发给了员工工资（如绩效奖金核算错误、重复发放补贴等），那么公司要求员工退还多发放的部分工资是合理合法的。此时，员工应当退还多得的工资，因为这属于不当得利，依据《民法典》的相关规定，获得不当利益者应当返还。
违反协议约定：
- 若员工与公司签订的劳动合同或其他相关协议中有明确约定，例如约定员工在服务期内辞职需要退还部分已发的培训补贴等特定款项，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么员工辞职时公司依据该约定要求退还相应款项可能是合法的。但此类约定的内容必须清晰明确，且签订过程需符合法律规定，不存在欺诈、胁迫等情形。
造成经济损失：
- 如果员工在职时有严重违纪行为给公司造成了重大损失，且公司规章制度明确规定可从工资中扣除赔偿费用，辞职时已发工资若未足额扣除该赔偿款，公司有权要求员工退回相应部分以弥补损失。但公司需提供确凿的证据证明员工的违纪行为、损失的具体数额以及规章制度的相关规定。
二、非法退还工资的情形
公司无理要求：
- 如果公司以员工辞职为由要求退还已支付的工资，且没有合理的法律依据或合同约定，这种行为侵害了员工获取劳动报酬的权利，因此是不合法的。劳动者依法享有获得劳动报酬的权利，公司无权随意要求退还。
公司违法或违规行为：
- 如果工资退还的原因是公司有违法或者违规行为，比如用工资拆分来避税和社保，那么要求员工退还工资就是违法行为了。此时，员工不仅无需退还工资，还可以向相关部门举报公司的违法行为。
三、劳动者权益保护
协商与投诉：
- 如果公司无正当理由要求员工退还工资，员工可以先与公司进行友好协商，要求公司说明理由。若协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
保留证据：
- 劳动者在离职时应保留好相关的工作证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以便在需要时作为维权的依据。这些证据有助于证明员工的劳动时间和工资情况，从而维护员工的合法权益。
总结来看，工资退还是否合法取决于具体情况和原因。如果公司要求退还工资有合理的法律依据或合同约定，并且员工确实存在不当得利或违反协议约定的情形，那么退还工资是合法的。但如果公司无理要求或存在违法违规行为，员工则无需退还工资，并可以依法维权。如果您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。