发现过期食品商户当场销毁，市场监管部门不必然立案，需结合具体情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、市场监管部门立案的法律依据与考量因素
根据《市场监督管理行政处罚程序规定》第十八条第一款，市场监督管理部门对发现的违法行为线索，应在一定期限内核查并决定是否立案。但该规定第二十条也明确了可以不予立案的情形，包括：
违法行为轻微并及时改正，没有造成危害后果：例如，在日常检查中发现商户有少量过期食品，但商户发现后立即自行销毁，未进行销售，也未造成消费者健康损害等后果，此时市场监管部门可不予立案。
初次违法且危害后果轻微并及时改正：如某小餐馆初次出现少量过期调料未及时清理，但在监管部门检查发现前已自行更换，且未对菜品质量产生实质性影响，此时也可考虑不予立案。
当事人有证据足以证明没有主观过错：如果商户能够证明其已履行了合理的注意义务，如按照规定的流程进货、储存、检查等，但因不可预见或难以控制的原因导致食品过期，且无主观故意或重大过失，此时市场监管部门也可不予立案。
二、商户销毁过期食品后的法律后果
商户发现过期食品后当场销毁，这一行为本身表明了商户对食品安全问题的重视和及时改正的态度。然而，是否立案并不仅仅取决于商户是否销毁了过期食品，还需要综合考虑其他因素，如：
过期食品的数量和种类：如果过期食品数量较多或种类涉及高风险食品，市场监管部门可能会更倾向于立案调查。
是否已造成实际危害：如果过期食品已被销售并导致消费者健康受损，那么市场监管部门几乎肯定会立案调查。
商户的过往记录：如果商户之前有过类似违法行为或多次被投诉，市场监管部门也可能会更严格地处理。
三、法律建议
商户应持续加强食品安全管理：即使当场销毁了过期食品，商户也应反思自身在进货、储存、检查等环节是否存在疏漏，并采取措施加以改进，以避免类似问题再次发生。
积极配合市场监管部门的调查：如果市场监管部门决定立案调查，商户应积极配合，提供相关证据和资料，以证明自身没有主观过错或已及时改正。
关注消费者反馈：商户应密切关注消费者的反馈和投诉，及时处理并改进相关问题，以维护自身声誉和消费者信任。
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