结论前置：
- 若部门扣工资行为无合法依据，则属于违法行为，您有权要求部门补发工资并可能获得赔偿。
- 若部门扣工资行为有合法依据（如规章制度明确且合法），则可能不构成违法，但您仍有权了解扣款原因并寻求合理解决方案。
详细分析：
首先，我们需要明确的是，在工伤期间，员工依法应享受工伤待遇，这包括但不限于医疗费用报销、停工留薪期间的工资福利等。根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
针对您提到的“工伤期间单位全额发放但部门给扣工资”的情况，我们可以从以下几个角度进行分析：
一、部门扣工资行为是否合法
若部门扣工资无合法依据：
- 根据法律规定，工伤期间员工应享受全额工资福利。若部门无正当理由扣减工资，则违反了法律规定，侵犯了您的合法权益。
- 在此情况下，您有权要求部门补发被扣减的工资，并可能根据具体情况要求部门支付赔偿金或承担其他法律责任。
若部门扣工资有合法依据：
- 某些情况下，部门可能根据内部规章制度或劳动合同中的约定，在特定条件下扣减工资。但这些规章制度或约定必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 若部门扣工资的行为有合法依据（如规章制度明确且合法，且已向您公示或告知），则可能不构成违法。但即便如此，您仍有权了解扣款的具体原因，并寻求合理的解决方案。
二、您应如何维护自己的权益
与部门沟通：
- 首先，您可以尝试与部门负责人或人力资源部门进行沟通，了解扣款的具体原因和依据。
- 若沟通无果或您认为扣款行为不合法，您可以进一步采取法律措施。
向劳动监察部门投诉：
- 若您认为部门扣工资的行为违反了法律法规，您可以向当地的劳动监察部门投诉。
- 劳动监察部门将依法进行调查，并根据调查结果作出相应的处理。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若您与部门之间的争议无法通过沟通或投诉解决，您可以考虑申请劳动仲裁或提起诉讼。
- 在劳动仲裁或诉讼过程中，您需要提供相关证据证明部门扣工资的行为违法，并要求部门承担相应的法律责任。
三、注意事项
- 在维护自己权益的过程中，您应保留好相关证据，如工资条、扣款通知、劳动合同等。
- 若您对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到有效保障，您可以考虑咨询专业律师（即向我咨询）以获取更具体的法律建议和帮助。
最后，我希望您能够顺利解决这个问题，并维护好自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。