同一公司同一职位分别签订标准工时制和不定时工作制，从法律角度来看，这种做法本身并不直接违法，但需要满足一定的条件和程序，并且可能引发一些后续的法律问题或争议。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律允许性：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位可以根据工作需要和岗位特点，选择实行标准工时制、不定时工作制或综合计算工时工作制。因此，从法律层面讲，同一公司同一职位分别签订不同工时制是允许的，但前提是必须符合相关法律法规的规定，并经过必要的审批程序。

2. 审批程序：

   • 对于不定时工作制，用人单位通常需要向当地劳动行政部门提出申请，并获得批准后方可实施。如果用人单位未经审批就擅自实行不定时工作制，可能会面临法律风险。

3. 员工权益保障：

   • 无论实行哪种工时制，用人单位都必须保障员工的合法权益，包括但不限于休息休假权、劳动报酬权等。对于实行不定时工作制的员工，用人单位应当确保其平均日工作时间和平均周工作时间与法定标准工作时间基本相符，并支付相应的加班费或调休。

4. 潜在法律问题：

   • 如果同一公司同一职位的员工分别签订了不同工时制的劳动合同，可能会引发员工之间的不公平感或争议。特别是当实行不定时工作制的员工认为自己的工作负担过重或权益受到侵害时，可能会通过法律途径寻求救济。

5. 建议：

   • 对于用人单位而言，在决定实行不同工时制时，应当充分考虑员工的意见和需求，确保决策的合法性和合理性。同时，应当加强与员工的沟通和协商，明确双方的权利和义务，避免引发不必要的法律纠纷。
   • 对于员工而言，如果发现自己被签订了不合理的工时制合同或认为自己的权益受到侵害，应当及时向用人单位提出异议或寻求法律帮助。

综上所述，同一公司同一职位分别签订标准工时制和不定时工作制本身并不直接违法，但需要满足一定的条件和程序，并且用人单位必须保障员工的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。