不定时工作制在符合法律规定并经过合法审批的情况下是合法的，但企业必须确保劳动者的合法权益得到充分保障。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律基础与合法性条件
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十九条，企业因生产特点不能实行标准工时制度（即每日工作时间不超过八小时，平均每周工作时间不超过四十四小时）的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。这为不定时工作制的实施提供了明确的法律基础。
适用范围：
- 不定时工作制主要适用于因工作性质特殊、需机动作业或工作时间不固定的岗位。例如，企业中的高级管理人员、外勤人员、长途运输人员、部分值班人员等，这些岗位的工作时间难以按照标准工时制度进行衡量。
审批程序：
- 企业实行不定时工作制前，必须向当地劳动行政部门提出申请，并提交包括企业基本情况、申请工种或岗位名称、申请理由等在内的详细材料。劳动行政部门将对申请进行审核，必要时进行实地调查，符合条件者将予以批准并出具审批文件。未经审批擅自实行的，将面临法律风险，且该约定可能无效。
二、劳动者权益保障
休息休假权利：
- 即使实行不定时工作制，劳动者同样享有法定节假日、年假、病假等休息休假权利。企业应合理安排劳动者的休息休假时间，确保其身心健康，避免过度加班。在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，企业应当依法支付工资。
工作时间安排与加班问题：
- 虽然不定时工作制不固定具体工作时间，但仍需遵守每周工作时间不超过四十四小时的限制（特殊情况下需缩短工作时间的，按照国家有关规定执行）。企业应与劳动者明确工作任务、工作时间安排及加班认定等相关事宜，以避免纠纷。对于在法定节假日工作的劳动者，企业应按照法律规定支付不低于工资的300%的工资报酬。
工资支付：
- 企业应按照法律法规和劳动合同的约定，合理确定不定时工作制劳动者的工资报酬，并确保不得低于当地最低工资标准。在法定节假日、婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，企业同样应按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的相应比例支付工资报酬。
三、实际操作建议
企业角度：
- 在申请不定时工作制时，企业应充分了解并遵循审批程序，确保申请材料的真实性和完整性。
- 在实施过程中，企业应注重与劳动者的沟通与协商，明确工作安排和休息时间，避免产生纠纷。
- 企业应加强内部管理，确保不定时工作制下的劳动者权益得到充分保障，避免过度加班和侵权行为的发生。
劳动者角度：
- 劳动者应了解自己的权益，包括休息休假权利、工资支付等，并在必要时寻求法律援助以维护自身合法权益。
- 在签订劳动合同时，劳动者应仔细阅读合同条款，特别是关于工作时间和工资支付的条款，确保自己的权益得到明确保障。
总结来说，不定时工作制在符合法律规定并经过合法审批的情况下是合法的，但企业必须确保劳动者的合法权益得到充分保障。如果您或您所在的企业有关于不定时工作制的具体问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将为您提供专业的法律意见。