劳动合同中约定不定时工作时间制，在符合法律规定并经过合法审批的情况下是合法的。以下是对这一问题的详细分析：

一、不定时工作制的定义与合法性条件

不定时工作制是一种针对特定职工群体设立的弹性工作时间制度，它适用于因工作性质、特点或工作职责的限制，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工。根据《中华人民共和国劳动法》第三十九条的规定，企业因生产特点不能实行标准工时制度的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，这包括不定时工作制。

合法性条件主要包括：

1. 适用范围合法：不定时工作制主要适用于企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员、部分值班人员及其他因工作无法按标准工作时间衡量的职工，以及长途运输人员、出租汽车司机等因工作性质特殊需机动作业的职工。
2. 程序合法：用人单位必须向劳动行政部门提出实行不定时工作制的申请，并提交相关材料，经审查批准后方可实施。未经审批擅自实行的，可能会面临处罚，且该约定可能无效。

二、审批程序与备案要求

企业实行不定时工作制的审批程序通常包括以下几个步骤：

1. 申请：用人单位根据自身生产经营特点和实际工作需要，向劳动行政部门提交实行不定时工作制的申请及相关材料，如企业的营业执照副本、组织机构代码证、实行不定时工作制的岗位设置及人员名单、工作时间安排计划等。
2. 审查：劳动行政部门对提交的材料进行详细审查，重点考察用人单位的生产经营特点、工作岗位性质、工作时间安排等是否符合实行不定时工作制的条件。
3. 批准：经审查符合条件的，劳动行政部门作出批准决定，并向用人单位颁发《不定时工作制审批决定书》。用人单位在获得批准后，方可在批准的岗位和人员范围内实行不定时工作制。

同时，企业应保留相关审批文件和记录，以备未来可能的审查或审计。

三、劳动者权益保障

虽然不定时工作制的工作时间具有灵活性，但劳动者的合法权益仍然受到法律的严格保护：

1. 休息休假权利：不定时工作制的劳动者同样享有法定节假日、年假、病假等休息休假权利。用人单位应合理安排劳动者的休息休假时间，确保其身心健康，避免过度加班。在法定休假日和婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，应当依法支付工资。
2. 工作时间安排与加班问题：虽然不定时工作制不固定具体时间，但仍需遵守每周工作时间不超过四十四小时的限制（原则上平均每天工作8小时，每周至少休息1天）。用人单位应与劳动者明确工作任务、工作时间安排及加班认定等相关事宜，以避免纠纷。同时，对于在法定节假日工作的劳动者，用人单位应按照法律规定支付不低于工资的300%的工资报酬。
3. 工资支付：用人单位应按照法律法规和劳动合同的约定，合理确定不定时工作制劳动者的工资报酬，并确保不得低于当地最低工资标准。

四、不合法的情况与法律风险

若用人单位未经劳动行政部门审批擅自实行不定时工作制，或虽经审批但违反规定随意延长工作时间且不支付加班工资，则此做法不合法。劳动者可依据《中华人民共和国劳动法》等相关法律维护自身权益，用人单位可能面临法律风险和处罚。

举例说明：

假设某企业未经审批擅自对销售人员实行不定时工作制，并要求销售人员长时间工作且不支付加班费。销售人员可以向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求企业支付加班费并可能获得经济补偿。如果企业被认定违法实行不定时工作制，还可能面临劳动行政部门的处罚。

综上所述，劳动合同中约定不定时工作时间制在符合法律规定并经过合法审批的情况下是合法的。企业在实行不定时工作制时，应严格遵守相关法律法规，确保员工的各项权益得到充分保障。如果您在劳动合同中遇到了不定时工作时间制的相关问题或疑虑，可以直接向我咨询。