不定时工作制下，劳动者每周工作时间超过50小时是否合法，不能一概而论，关键在于是否符合法律规定并保障了劳动者的合法权益。以下从不同角度进行分析：
一、不定时工作制的合法性基础与实施条件
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十九条，企业因生产特点不能实行每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。这为不定时工作制的实施提供了明确的法律基础。
审批程序：
- 企业实行不定时工作制前，必须向当地劳动行政部门提出申请，并提交包括企业基本情况、申请工种或岗位名称、申请理由等在内的详细材料。劳动行政部门将对申请进行审核，必要时进行实地调查，符合条件者将予以批准并出具审批文件。未经审批擅自实行不定时工作制，或超出审批范围实施的，均属违法行为。
二、不定时工作制下的工作时间与劳动者权益保障
工作时间限制：
- 虽然不定时工作制不直接受每日8小时、每周44小时的限制，但企业仍应确保劳动者有必要的休息时间。原则上，劳动者平均每天的工作时间应控制在8小时左右，且每周至少应保证有1天的休息时间。若企业安排劳动者每周工作时间超过50小时，且未提供足够的休息时间或未支付相应的加班费，则可能违反法律规定。
加班费支付：
- 在不定时工作制下，劳动者在法定节假日、婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，企业应按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的相应比例支付工资报酬。若因工作需要安排劳动者在休息日或法定节假日加班，企业应依法支付加班费。若企业未支付加班费，则劳动者有权要求企业补发，并可能因此向劳动行政部门投诉或提起劳动仲裁。
休息休假保障：
- 劳动者依法享有的年假、病假等各类法定假期，企业也应当予以保障。企业不得因实行不定时工作制而剥夺劳动者的这些法定权益。
三、实际操作中的建议与注意事项
企业角度：
- 企业在申请不定时工作制时，应充分了解并遵循审批程序，确保合法合规。
- 在实施过程中，应注重与劳动者的沟通与协商，明确工作安排和休息时间，避免过度加班和侵权行为的发生。
- 加强内部管理，确保劳动者的合法权益不受侵害，如按时足额支付工资、提供必要的休息时间等。
劳动者角度：
- 劳动者应了解自己的权益，包括工作时间、休息休假、加班费支付等方面的规定。
- 若发现企业存在违法行为或侵犯自己权益的情况，应及时向企业提出异议或向劳动行政部门投诉。
- 在必要时，可以寻求法律援助或提起劳动仲裁以维护自身合法权益。
总结来说，不定时工作制下劳动者每周工作时间超过50小时是否合法，取决于企业是否依法获得了审批、是否保障了劳动者的休息休假权益以及是否支付了相应的加班费。若企业未遵循这些规定，则可能面临法律风险。因此，建议企业和劳动者都应充分了解并遵守相关法律法规，以确保劳动关系的和谐稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。