针对您提出的“医院考三基不及格扣钱是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动法规和医院内部管理规定的重要议题。以下是我对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确的是，医院作为用人单位，有权根据其内部管理规定和岗位需求，对员工进行相应的考核和评估。三基考核（通常指基础理论、基本知识、基本技能）作为医院对员工专业能力的一种评估方式，其目的在于提升员工的专业素养和服务质量。

然而，关于考核不及格是否扣钱的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个因素：

1. 劳动合同约定：

   • 员工与医院签订的劳动合同中，是否明确规定了考核不及格将扣钱的条款。如果劳动合同中有此约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么医院在考核不及格时扣钱可能是合法的。

2. 医院内部管理规定：

   • 医院是否有明确的内部管理规定，规定了考核不及格将扣钱的措施。这些规定是否经过民主程序制定，是否向员工公示，以及是否符合法律法规的要求，都是判断其合法性的关键因素。

3. 法律法规的强制性规定：

   • 根据《劳动法》和《劳动合同法》等相关法律法规，用人单位不得随意克扣员工的工资。如果医院的扣钱行为违反了这些法律法规的强制性规定，那么该行为就是不合法的。

4. 扣钱的合理性和必要性：

   • 即使劳动合同或医院内部管理规定中有扣钱的条款，也需要考虑扣钱的合理性和必要性。扣钱应当与员工的过错程度、造成的损失等因素相匹配，不能过度或不合理地扣减员工的工资。

结合您提供的参考信息，我们可以看到，在某些情况下（如定点医药机构考核不及格将扣除全部保证金），扣钱行为是有明确的法规依据和管理规定的。但这种情况通常适用于特定的机构或行业，并且有严格的考核标准和程序。

对于医院而言，如果其扣钱行为没有明确的法律依据或管理规定支持，或者扣钱行为违反了法律法规的强制性规定，那么该行为就是不合法的。员工在遇到此类情况时，可以首先与医院进行沟通协商，了解扣钱的具体原因和依据；如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，医院考三基不及格扣钱是否合法，需要综合考虑劳动合同约定、医院内部管理规定、法律法规的强制性规定以及扣钱的合理性和必要性等多个因素。