医院绩效考核扣工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若绩效考核制度合法且扣款合理：

   • 制度合法性：医院作为用人单位，有权根据自身经营管理的需要，制定绩效考核制度。但这一制度必须经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等），并且已向劳动者公示或告知。这是确保制度合法性的关键步骤。
   • 扣款合理性：绩效考核扣款应当基于明确、合理的考核标准，且扣款金额不得超过法定限额。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 合法情形示例：若医院制定了合法的绩效考核制度，且扣款是基于劳动者未达到考核标准而进行的合理扣减，同时扣款金额未超过法定限额，那么这种扣款是合法的。

2. 若绩效考核制度不合法或扣款不合理：

   • 制度不合法：如果医院的绩效考核制度未经民主程序制定，或者未向劳动者公示或告知，那么该制度对劳动者不具有约束力。医院以此制度为依据扣减工资，属于违法行为。
   • 扣款不合理：即使绩效考核制度合法，但如果扣款金额超过了法定限额，或者扣款并非基于劳动者本人原因造成的经济损失，那么这种扣款也是不合法的。
   • 违法情形示例：若医院未制定合法的绩效考核制度，或者扣款金额超过了劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，那么这种扣款就是违法的。

法律建议：

• 对于劳动者：如果认为医院的绩效考核扣款不合法，可以先与医院进行协商，要求医院提供扣款的依据和合理性说明。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于医院：在制定和执行绩效考核制度时，应确保制度的合法性和合理性，遵守相关法律法规的规定。同时，应加强与劳动者的沟通和解释工作，避免因扣款问题引发劳动纠纷。

可能后果：

• 若医院违法扣款：可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。同时，还需要承担向劳动者支付被扣减的工资及可能的赔偿金等法律责任。
• 若劳动者维权：在劳动仲裁或诉讼中，如果劳动者能够证明医院的扣款行为违法，那么医院可能需要承担支付工资、赔偿金等法律责任。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。