结论前置：若公司仅以毕业证是假的为由开除员工，且该员工已在公司工作十一年，员工有可能获得赔偿，但具体需根据实际情况判断。

分析说明：

1. 劳动合同法的相关规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同，其中并未直接提及毕业证真假作为解除劳动合同的依据。
   • 若公司认为员工存在欺诈行为（如使用假毕业证入职），则需根据该法第三十九条第五项“因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的”来解除劳动合同。但此情况下，公司需承担证明员工存在欺诈行为的举证责任。

2. 赔偿的可能性：

   • 若公司无法证明员工存在欺诈行为，或虽能证明但解除劳动合同的程序不符合法律规定（如未提前通知、未支付经济补偿等），则员工有权要求公司支付赔偿金。
   • 赔偿金可能包括经济补偿金（根据员工在公司工作的年限计算）、未休年假工资、加班费等。

3. 实际操作的考虑：

   • 员工应首先与公司进行沟通，了解公司解除劳动合同的具体原因和依据，并保留好相关证据。
   • 若沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或提起劳动仲裁申请，要求公司支付赔偿金。
   • 在劳动仲裁或诉讼过程中，员工需提供充分证据证明公司解除劳动合同的行为违法或不当。

总结： 因此，若公司仅以毕业证是假的为由开除员工，且无法证明员工存在欺诈行为或解除劳动合同的程序不符合法律规定，员工有可能获得赔偿。但具体赔偿金额和赔偿项目需根据实际情况判断，并需通过劳动仲裁或诉讼程序来争取。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。