公立医院绩效考核方案是否规定亏本的科室不发奖金，这个问题并不是由单一的文件或政策直接决定的，而是需要根据具体的绩效考核方案和医院管理规定来确定。

首先，从公立医院绩效考核的总体原则来看，绩效考核通常是为了推动医院的高质量发展，提高医疗服务能力和水平，同时调动医务人员的积极性。因此，绩效考核方案往往会综合考虑医院的整体运营情况、医疗质量、服务效率、患者满意度等多个方面。

关于亏本科室是否发放奖金的问题，这通常取决于医院的薪酬制度和绩效考核的具体指标。在一些医院中，可能会将科室的收支情况作为绩效考核的一个方面，但并不是唯一的决定因素。即使科室出现亏本，如果其在其他方面的绩效表现优秀，比如医疗质量高、患者满意度高等，仍然有可能获得一定的奖金。

另外，也有一些医院可能会采取更加灵活的薪酬制度，允许科室在亏损的情况下通过其他途径获得补偿或奖励。例如，通过提高医疗服务质量、增加患者满意度等方式来争取更多的绩效奖励。

总的来说，公立医院绩效考核方案是否规定亏本的科室不发奖金并没有一个统一的答案。这需要根据具体的绩效考核方案、医院管理规定以及实际情况来确定。如果您对所在医院的绩效考核方案有疑问或不了解，建议咨询医院相关部门或负责人以获取更准确的信息。