分公司代替总公司给其他分公司发放工资，这一行为在法律上并非明确禁止，但其合法性需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 公司内部管理规定：

   • 首先，要查看总公司与分公司之间的内部管理规定或协议。如果公司内部有明确规定或协议允许分公司代发工资，且该规定或协议不违反法律法规，那么这一行为在法律上就是合法的。

2. 税务和社保缴纳：

   • 分公司代发工资时，必须确保税务和社保的缴纳符合相关法律法规。如果因代发工资导致税务或社保缴纳出现问题，如漏缴、少缴或错缴，那么这一行为就可能构成违法。

3. 劳动者权益保护：

   • 代发工资不能损害劳动者的合法权益。如果因代发工资导致劳动者工资被拖欠、克扣或延迟发放，那么这一行为就违反了劳动法律法规，属于违法行为。

4. 资金流转和会计记录：

   • 分公司代发工资时，资金流转和会计记录必须清晰、准确。如果因代发工资导致资金流转混乱或会计记录不实，那么这一行为可能涉嫌违反财务和会计法规。

综上所述，分公司代替总公司给其他分公司发放工资并非绝对合法或非法，而是需要根据具体情况来判断。如果公司内部有明确规定或协议，且代发工资行为符合税务、社保、劳动者权益保护和资金流转等方面的法律法规，那么这一行为就是合法的。反之，如果违反任何一方面的法律法规，那么这一行为就是违法的。因此，在进行代发工资操作前，建议公司务必咨询专业律师或相关机构，确保行为的合法性。